肛瘘手术疼痛，需要根据病人的体质来判断，如果病人的体质比较敏感，那么手术中就会有明显的疼痛，反之，就没有明显的疼痛。手术结束后，应迅速进食液体或半液体食物，保持大便清洁，尽量避免便秘，加重病情，保持局部卫生清洁。
术后会感觉到肛周疼痛。因为肛周皮肤是齿状线下方，属于体神经支配的区域，对疼痛刺激敏感，通常是可以忍受的。可以选择应用温盐水坐浴的办法，能够缓解疼痛，手术以后也应该积极进行静脉抗感染治疗。
二级疼痛。肛瘘大多采用拔线手术，术后要定期绷紧线，这主要是为了保持橡皮筋的作用，可以起到慢性切割、绷紧线时有疼痛症状，一般一个月后肛瘘手术后要用橡皮筋绷紧线将基本拉紧。
肛瘘手术后会痛的，建议调整好心态，不要有太大的压力。在手术后多喝热水，多吃些维生素的食物，和一些水果和蔬菜，多服用一些容易消化的食物，禁止暴饮暴食，饮食要以清淡为主，不要吃辛辣等刺激性的食物，并且要积极的去医院进行复检。
肛瘘多采用挂线法，术后应定期收紧。这主要是为了保持橡皮筋起到慢性割伤的作用会出现疼痛症状。操作一个月后，橡皮筋会基本脱落。然而，如果有些病人肛瘘位置太高，时间可能会更长。