手指和脚趾的大拇指甲真菌感染，就是常说的灰指甲，这个疾病治疗比较缓慢，使用抗真菌的药物进行治疗，至少口服半年，期间每月一次查肝功能。其指甲真菌感染，至少口服药物治疗3个月。
灰指甲就是真菌感染引起的，因为真菌感染是发生在指甲内侧。真菌感染对灰指甲的传播是比较常见的，不过真菌是不容易从指甲里面漫出来的，另一个方面灰指甲是需要拔除指甲盖来治疗的，配合具有渗透性的药物治疗效果会比较好。
指甲真菌感染大多不能自愈，患者应积极治疗。
皮肤癣菌侵犯甲板及甲下所引起甲病变，俗称“灰指甲”。甲癣的病程缓慢，如果不进行治疗，可终身不愈，所以患者大多不能自愈。建议患者在医生的指导下使用阿莫罗芬、环吡酮胺、特比萘芬、伊曲康唑、氟康唑等抗真菌药物进行治疗，能够有效改善病情。
生殖器感染者应服用抗感染药物调理。
若发生生殖系统感染，可选用诺氟沙星胶囊，左氧氟类或头孢类用药处理，还可进行药物敏感试验，结合药敏试验结果，在医师指导下，选用适当用药。治疗期间患者要注意保持清淡饮食，不要吃辛辣、刺激性食物，有利于身体的恢复。
指甲真菌感染可内服药物，单纯服用抗真菌药物，如灰黄霉素、氟康唑、斯皮仁诺等药物均有一定疗效，并且方便，但因为这类药物必须达到真菌所寄生的甲板处，才能发挥抗菌作用。患者应该尽早前往医院，在专业医生的指导下进行治疗。在生活当中也应当注意，不要过度的情绪激动，不要吃热性的食物，多吃蔬菜水果。平时少吃辛辣刺激的食物，忌烟酒，保持充足的睡眠，少熬夜。
一般来说，脸部真菌感染用硝酸咪康唑乳膏、阿莫罗芬乳膏等药有效。
脸部的真菌感染可以使用抗真菌的药物。例如：萘替芬康唑乳膏、联苯苄唑乳膏、硝酸咪康唑乳膏、阿莫罗芬乳膏、酮康唑乳膏、酸舍他康唑乳膏、盐酸特比萘芬涂剂。另外，如果是真菌感染导致的肉芽肿，需要服用伊曲康唑胶囊、氟康唑片、特比萘芬片等抗真菌药物。
