腱鞘囊肿部分可以自愈，有一部分严重的不能自愈。
肌腱囊肿与腕部的过度疲劳、或是长期患有关节炎等相关的病症有关，其中腱鞘囊肿与其它的病症相比具有自我修复的趋势，一些不需要进行有效的处理就会自行消失。腱鞘囊肿并不是特别的严重，可以通过推拿来减轻肿痛。如果病情加重，并且腱鞘囊肿过大后很难恢复，并且会造成更大的损伤。
因此，如果是不能自行消失的腱鞘囊肿，可以通过针灸和外科的方式来进行，而外科治疗通常是用于针灸来解决无效的。
典型表现为腕部、足背部等局部皮下圆形或椭圆形囊性肿物，一般无痛。是可以进行挤压的，可以自己轻轻按摩囊肿，但避免暴力挤压或用重物敲击囊肿。腱鞘囊肿的发生可能与局部损伤或劳损有关。腱鞘囊肿一般不会有明显的表现，只要多注意休息和观察即可。
但是随着腱鞘囊肿的增大，出现了相应的神经、血管等症状，要及时的进行治疗，可以采取穿刺抽吸-药物注射法、手术治疗、关节镜治疗等方式进行治疗，以免损害机体的健康。
腱鞘囊肿可以通过烤电来进行改善，但是只能起到缓解作用。
烤电主要是为了加快血管内的血液流通，加快囊液的吸收，但对于肌腱鞘囊肿，则只能略减轻症状。所以如果囊肿很大，对周边组织造成很大的压力，需要用针筒进行抽吸术，也可以通过外科切除囊。厅要适当注意休息，病情严重者更要卧床休息，散步的时候，应当注意配合深呼吸，避免受凉。
腱鞘囊肿一般不可以揉。
腱鞘囊肿典型表现为腕部、足背部等局部皮下圆形或椭圆形囊性肿物，一般无痛。腱鞘囊肿多数病例症状不明显，因此无需特别处理，留意休息即可，切忌反复揉搓按摩局部，由于揉搓按摩很可能使局部扩大。在经过一段时间之后，囊壁开始增厚并形成一个硬结。如腱鞘囊肿渐大，甚或有部分疼痛表现，手术切除可考虑。
腱鞘囊肿可以针刺，但是需要在医生的指导下进行。
腱鞘囊肿是一种比较普遍的病症，通常发生在手腕背和足背，腱鞘囊肿是一种局部肿物，随着时间的推移会慢慢的增大，如果有了腱鞘囊肿，就不要再用针刺了，否则会伤到韧带。如果发现了肌腱鞘囊肿，首先要到正规的医疗机构进行全面的检查，并对其进行相应的处理，可以通过针灸来进行调理，但绝对不能这么做。针刺疗法一般是在囊肿周围用针扎破，然后在囊肿部按压，将囊腔内的液体挤压出来，使囊肿变小，这样才能痊愈。肌腱鞘囊肿可以采用针刺或外科的方法进行治疗，手术是将囊肿完全清除，但复发的可能性很小。