早期发现时可先观察避免挤压，有些囊肿可自行消退，无需处理。如无法消退则以手术切除为主要手段，将囊肿及周围手术区域内的小腺体一并切除，但缝合时仍可能将周围腺体的导管阻塞再次形成囊肿。
有的。粘液腺囊肿发病原因就是腺体导管的损伤或阻塞，本病的治疗以手术切除治疗效果较好，口服药物一般无效。手术时应将囊肿及其相连的腺体一并切除，以防复发。周围腺组织应尽量减少损伤，唇部血供丰富，只要对位缝合良好，一般不会形成大的斑痕，又是在嘴唇内部，对美观应该不会有太大影响。
可以通过导航微电极介入术运用世界顶尖电子声影导航仪，将卵巢、囊肿立体定位显示，细如发丝的微电极放入囊腔，吸出囊内积液，再由微电极介入治疗系统将遏制囊肿再生的药物介入囊肿处，通过电离作用，使囊肿病灶组织细胞核抑制失活，达到治疗囊肿的目的。
大部分都是良性的，但是有百分之10到20左右也是恶性的，做腹腔镜手术进行切除，并且在手术后还需要做化疗或放疗防止复发，在粘液腺卵巢囊肿治疗好以后，才有怀孕的可能性，不然会引起不孕。
粘液囊肿建议到正规医院的口腔科进行治疗，粘液囊肿主要由炎症刺激引起的粘膜下粘液腺阻塞引起，它主要发生在口腔或舌下，如果粘液囊肿长在嘴唇上或舌头下，不及时处理，将会对其功能造成障碍。
