灌肠除了对肠粘膜有一定的刺激以外，对孩子的身体健康无大碍。建议灌肠过程中注意保暖，避免受凉，选择粗细适宜的肛管，动作应轻柔。灌肠过程中及灌肠后应注意观察病情，如发现面色苍白，异常哭闹，腹胀或排出液为血性时，应立即停止灌肠。
宝宝发烧后，不要给宝宝灌肠，肠道也是有粘膜的，如果经常灌肠对宝宝也不好，如果不想吃药，可以给宝宝外用退热栓，一般发烧可能是患急性上呼吸道感染，主要是病毒感染引起的，如呼吸道合胞病毒，腺病毒，流感或者副流感病毒等。
灌肠是将一定量的液体流入肛门，经直肠灌入结肠，以帮助患者清理肠道、排便、排气或者由肠道供给药物或营养，达到确定治疗或者治疗目的的方法。将灌肠的管子插在肛门上十厘米左右即可，不可太过于深，也不要出现溢出的表现。
一般情况下，灌肠若按照正确的操作方法则无危害。具体分析如下：
通常来讲，灌肠是将药物灌入直肠内达到其治疗的目的，一般分为清洁灌肠和保留灌肠两种。其中，清洁灌肠适应于结直肠手术的术前准备、内镜检查前的肠道准备，还可以用于粪便嵌塞的治疗等。而保留灌肠一般对药物的量、温度有严格的要求，如温度在36度左右，药物常用量在50至100ml，此方法是治疗直肠肛门疾病和妇科炎症的常用方法。
直肠黏膜皱褶少，无绒毛，吸收面积小，药物吸收比较缓慢，进入血液循环的药量特别有限。另外，灌肠也不是一种安全、无菌的给药方式，肠道内含有很多细菌，有可能随着滴入液进入肠道深处，造成污染。
