相对来说，抗孕激素制剂的紧急避孕药副作用比较小。
一般情况下，紧急避孕药的副作用都比较大。不过相比起来，米非司酮片这种抗孕激素制剂的紧急避孕药副作用比较小。另外两种，分别是单孕激素制剂和雌孕激素复合制剂，比如左炔诺孕酮片，复方左炔诺孕酮片等，副作用相对可能比较大。在使用后可能会出现反胃、呕吐、腹部疼痛、不规律的阴道出血、经期失调等不良反应。
长效避孕药一般会引起恶心呕吐，不规则阴道流血，头晕，可能导致内分泌紊乱，月经不调，闭经，不孕，或者肠胃不适，头痛，体重增加，神经紧张，情绪低潮，皮肤色斑和粉刺等。每个人的身体素质不同，对药物的吸收能力也不同，所以出现的不良反应也不相同。
一般情况下，紧急避孕药虽然有不同的品种，但是紧急避孕药的主要成分并没有大的区别，一般都是以大剂量的孕激素或者是抗孕激素的药物为主。
如果吃避孕药，比如短效避孕药由于是雌孕激素的合剂，很可能会造成皮肤的改变，出现皮肤粗糙、弹性下降，并且出现没有光泽、长色斑的情况，不管是哪一种紧急避孕药，在一年内服用不能超过三次，否则容易造成月经紊乱，如果没有办法调整过来，对以后的生育能力会造成影响。
避孕药主要用于抑制排卵，具有抗卵子植入的作用。其优点是高效、长效，不需要每天服药，使用和分发方便，不影响性生活。然而，副作用也很明显。一些女性再次服用长效避孕药后，正常月经会增加，经期会延长。长期服用也可能导致闭经。长效避孕药和激素避孕药之间的相互作用会导致出血或避孕失败，应予以高度重视。
一般来说，服用避孕药后可能会使人体内的某些激素含量增高，还可能会抑制排卵，如果患者长期服用可能会影响怀孕。
患者应该在医生指导下用药，以免引起不良反应。建议长期服用避孕药的时间不要超过3年，如果引起月经失调的情况应遵医嘱停服避孕药。避孕药的副作用可能会因服用的时间长短或具体药物成分不同而有所差异，建议采取戴套、上环等避孕方式。
服用紧急避孕药的副作用是恶心、神经性头痛、阴道不规则出血等。
由于紧急避孕药的成分为大量孕激素，因此人体摄入容易出现一定副作用，可能会对身体造成一定影响，因此紧急避孕药激素含量大，部分患者容易出现恶心、呕吐等不适症状，少部分人可能会出现神经性头痛，还可能导致阴道不规则出血、月经周期改变，不利于身体健康。因此建议遵医嘱适量使用紧急避孕药，并且最好不要选择这种方式避孕。