注射乙肝疫苗的婴儿，由于身体差异，少数婴儿会出现头晕、头痛、发热、寒战、恶心、呕吐、疲劳、易怒、困倦、皮疹、手臂酸酸或注射部位肿胀、发热、硬化等类似于一般疫苗接种的轻微症状，一般会缓解。
接种乙肝疫苗后可以维持5-12年，因此，可以5年左右进行一次表面抗体检查，若乙肝表面抗体弱阳性，可以乙肝疫苗加强接种一次。接种乙肝疫苗的注意事项应该保障接种机体在身体健康，如果病人感冒、发烧等疾病，应该推迟接种时间。
打完疫苗之后出现发烧是疫苗后的正常的反应，最重要的是观察体温的变化，比如体温在37.2到38度之间属于低热，需要物理降温进行处理。贴降温贴，需要多喝温开水，还可以用温水擦拭脖子、腋窝、大腿根部、来降温。如果体温在38度到39度之间，这个时候需要口服退热药来处理，也需要多喝温开水，配合物理降温一起处理，有效达到降温效果。如果高温不退，需要立刻医院就诊，预防惊厥。
给予对症处理就可以了，超过了38.5度给宝宝口服退热药物，如果超过了三天，仍然有发热的情况下，需要到医院进行进一步的检查，明确一下原因。相对来说接种流感疫苗以后出现疫苗接种反应的概率更高一些，有的孩子甚至可能会出现流感一样的症状。
饮食上注意避免辛辣刺激凉的物给孩子，注意腹部保暖，预防针的确是有可能出现暂时拉肚子的副作用，一般比较轻，持续1到2天会好转，如果这样的大便一天有超过三次可以吃东西调理。
打完乙肝疫苗在短时间内可能会出现一些发热，出现一些皮疹，出现一些等其他的表现，还有可能会出现一些其他的一皮疹的可能，当然绝大部分的一些乙肝疫苗都不会有任何的表现，都是很安全的。