如果是很大的，第一个是卵巢的储备率下降，对卵巢功能造成损害。特别是恶性的，如果两侧卵巢都切除，会提前出现更年期；如果是良性的、切除单个的，甚至＜5cm这类的病例，切除后并发症是很少的。
卵巢畸胎瘤有的是良性的，也有的是恶性的，一般良性的表现比较多，见生长速度比较慢，也可以长期没有任何变化，有的可以缓慢增大的。在手术之后所接受的组织还需要进行相应的病理检查，也是作为确定性质的依据，一般良性的手术之后较少出现复发的。
卵巢畸胎瘤，如果是成熟卵巢畸胎瘤，复发率在2%左右，一般见于双侧病变的患者。如果是未成熟卵巢畸胎瘤，复发率在50%以上，而且从未成熟到成熟转化，但是随时间推移，恶性减低。
卵巢畸胎瘤手术多少钱在6000元-8000元左右。由于地域和医院的不同，收费标准各有差异。卵巢畸胎瘤术后基本没有后遗症，手术采用微创式的腹腔镜下手术，创伤小、恢复快，但费用相对较高。
卵巢畸胎瘤分为成熟型畸胎瘤和未成熟型畸胎瘤两种类型，分别采用不同的外科方法进行处理。
成熟型畸胎瘤多见于青年女性，一般应行手术切除；未成熟型畸胎瘤也是比较常见的，是恶性肿瘤，需要考虑到肿瘤的分级，以及外科治疗的范围。若从保存生殖能力的角度来看，应选择一侧辅助手术；在不需保留生殖能力的情况下，可以采用手术治疗，将患侧附件切除掉。
如果女性检查彩超，发现卵巢上有畸胎瘤，而且大于5厘米以上，那就需要住院行手术将畸胎瘤剥离，这时可以考虑行腹腔镜微创手术。通常在手术前需要静脉麻醉，然后在腹部、外阴消毒，并在肚脐和腹部两侧开2~3厘米的小孔，同时在小孔内注入二氧化碳充气，再将腹腔镜和超声刀伸入到腹腔内，找到畸胎瘤位置，并将畸胎瘤从卵巢上剥离。