通常来说，阴道流褐色分泌物是因为有少量的血液在阴道酸的作用下变成的黑褐色，一般常见于以下情况：
1、月经刚来和没有完全结束的时候，这时候月经量很少，就会呈现为褐色。
2、患者的阴道壁里边有很多皱壁，少量的血液藏匿在阴道壁当中，当体位变动的时候就排出体外了。
3、当有妇科病时，如有子宫肌瘤、子宫内膜炎、子宫颈炎、阴道炎等炎症，都会出现阴道流褐色分泌物的情况，建议患及时到医院就诊进行治疗。
阴道褐色分泌物的原因很多，如阴道炎、宫颈炎、子宫内膜炎、妇科良恶性肿瘤等。此时，需及时妇科门诊就诊，看有无其他伴随症状，可行妇科专科查体、阴道分泌物、宫颈脱落细胞学检查以及阴道超声检查以明确原因。
一般情况下，怀孕初期有黑褐色分泌物可以通过药物治疗、手术治疗等方式改善，具体内容如下：
怀孕初期有黑褐色分泌物，如果量少，点滴干净，没有任何不舒服的症状，应注意营养，不要过度劳累，要保持心情舒畅，不要紧张，要定期检查，不能随叫随到。如果出现大量的黑褐色分泌物，或者出现腰酸、腹痛等症状，需要及时就医，根据孕妇的症状、辅助检查等情况进行针对性的治疗。如果是先兆流产引起的，一定要找出原因，采取针对性的保胎措施；如果是因为宫外孕引起的，建议尽快进行手术，避免对胎儿的身体造成伤害。
月经黑褐色黏稠分泌物可能是正常的，也可能是黄体功能不全或者黄体萎缩不全造成的。如果出现在月经前两三天以及月经快干净的两三天，这种情况是正常的。这是因为子宫内膜脱落之后滞留在宫腔，淤积之后流出造成的。如果这种情况反复发作，可能是黄体功能不全或者黄体萎缩不全造成的，建议去医院妇科B超检查，排除器质性的病变，平时注意会阴清洁卫生，经期注意保暖。
黑褐色分泌物的发生原因有可能是体内激素水平不稳定所致，比如排卵期出血，怀孕以后因为黄体功能不全引起的出血，或者甲状腺功能低下引起的出血。也有可能是阴道炎、宫颈糜烂、子宫内膜炎、宫颈癌、子宫内膜癌、卵巢肿瘤等疾病引起。
如果患者月经之后出现黑褐色的阴道分泌物，通常情况下，可能是少量的阴道流血，遇到阴道的酸性环境而出现的黑褐色分泌物。但是如果患者月经超过了一周，出现了颜色的改变，考虑是月经没有完全干净，或者是有黄体萎缩不全等因素导致月经期延长。患者可以先服用益母草颗粒和保宫止血颗粒进行观察。如果效果不好的话，患者还可以在医生的指导下应用黄体酮进行治疗的。