原因尚不明确，环境因素和遗传因素相互作用。胎儿的心脏胚胎发育关键时期是在孕第3～8周，若母亲在此期间发生病毒感染，如巨细胞病毒、单纯疱疹病毒、风疹病毒等，导致胎儿患先心病和其他畸形的危险性增加。可能因素：妊娠糖尿病、接触职业因素、生殖系统感染、接触化学物、住新装修居室、服用药物、呼吸道感染、感冒发热、精神刺激、主被动吸烟、接触农药、接触噪声、孕妇饮酒、病毒感染、营养不良。
与引起先天性心脏病发作比较强的因素主要为早期宫内的感染，妊娠后头三个月是胎儿各器官发育最重要的阶段，因此妊娠后前三个月，孕母感染病毒性疾病容易胎儿发生先天性心脏病，不要接触射线和药物，一旦接触，尽量要少吃药，吃药会使胎儿发生先天性心脏病。
先天性心脏病跟母体的因素、遗传的因素和环境的因素有关。母体的因素主要是母亲在怀孕的早期，尤其是在心脏形成的阶段，受到外界环境的刺激导致出现心脏发育畸形。这些环境的刺激主要包括首先是病毒感染，一般的病毒，比如流行性感冒、普通的病毒感冒、风疹病毒、腮腺炎病毒或者柯萨奇病毒感染，都可以导致心脏发育畸形而出现先天性心脏病。
先天性心脏病通常不是遗传性的，不会影响后代。在准备怀孕之前，进行一次全面的检查。通过遗传染色体检查，指标正常，不会对胎儿造成不良影响，做好孕期保健工作。注意休息。
患上先天性心脏病的孩子，具体能生存多长的时间是不好确定的，因为这个病的病因主要和疾病的种类，以及病人自身的状态都会有一定的关系，而且有一些先天性心脏病的病人并不是都很严重，如果能够积极的配合手术治疗的化，大多数的宝宝是能够取得良好的预期效果的，更不会影响到正常的生存时间。如果是比较严重的先天性心脏病的病人，并且伴有其他并发症的化，这个时候存活时间可能在3~5年左右。
先天性心脏病分为以下几种类型：第一、左分流型，正常情况下体内循环的压力要比肺循环高，所以正常情况下左分流不会出现青紫，如果是剧烈的哭闹屏气或者是其他病理状态导致肺动脉或右心室的压力超过左心室的压力，可能会出现右向左分流，出现短暂的青紫，常见于室间隔缺损、房间隔缺损、动脉导管未闭等。第二、右向左分流，由于某些原因导致右心室压力升高，使左心室血流由右向左分流，最常见的是洛氏四联症。第三种是肺动脉狭窄，主动脉缩窄，多是左右两侧动静脉之间没有异常通路或分流。
