小儿头疼与原发性头疼综合症和继发体的病症有关，建议及时去医院就诊，明确具体情况，对症治疗。
原发头疼以偏头疼、神经痛及群聚头疼为特征。继发头疼一般与急性发热性病变、中枢神经系统感染、占位性病变等因素有关。而小儿头疼，一般都是因为一些比较严重的基础疾病，大部分都是因为病毒、上呼吸道感染等原因造成的，例如：流感，鼻炎，鼻窦炎等。
通常情况下，儿童脑炎好了头疼可能是脑炎的后遗症。具体情况分析如下：
脑炎是大脑实质的急性炎症，一般会出现发热、恶心、呕吐、意识模糊、头疼等症状，如果儿童之前的病情较为严重，或者未及时进行治疗，可能会出现儿童脑炎好了头疼的情况，家长可以按照医嘱给儿童使用安宫牛黄丸、清热醒脑灵丸、安脑丸等药物进行治疗。家长还可以按摩儿童的头部，缓解儿童的头疼。
小孩头晕头疼，最常见的原因是由于，上呼吸道病毒感染出现发烧。需要测量体温，如果体温超过38.5度以上，可以口服退热药物，同时口服抗病毒的药物。另一种情况有可能是病毒感染之后出现了病毒性脑炎，出现头晕，头疼，恶心，呕吐，嗜睡。
儿童出现头痛，需要用头痛的性质来判断具体的原因。如果是在二级医院，可以直接到儿科以及小儿内科进行治疗。如果是在儿童医院就诊，可以去神经内科让医生检查一下，看有没有贫血或者低血压状态引起的头晕。
经常头痛要到医院检查再对症治疗，做一个头颅CT检查，单纯是神经性头疼，吃点调节神经止疼的药物。要保持心情舒畅避免情绪暴躁不安，合理安排自己的作息时间，积极锻炼身体，头痛的原因很多。感染、青光眼、高血压、鼻窦炎、偏头痛、头部肿瘤等。
儿童头疼的位置常见的有前额部、双颞部、后枕部、顶部等，引起儿童头痛的原因比较多，如果孩子睡眠不佳，营养不良，贫血，感冒等都会引起孩子头疼的。如果孩子是因为睡眠不好引起的疼痛，保持孩子充足的睡眠既能缓解。如果孩子是因为营养不良或者是贫血引起的头痛，需要给孩子注意营养物质的摄入，平时给孩子多吃有补血功效的食物。