口腔溃疡的治疗主要是促进愈合，减少复发。促进愈合的治疗，主要有两个方面，一是预防感染，可以含漱抗感染的漱口水。二是促进黏膜修复，局部应用生长因子喷雾剂贝复剂，副作用较小效果好。特别是深大溃疡，长期不愈合的效果肯定；促进黏膜修复也可以局部应用激素，激素副作用较大，不能长期使用。减少复发，主要是西药调理免疫功能，中医中药辩证调理。局部减少创伤，防止形成溃疡。
经常出现口腔溃疡一般考虑是复发性的口腔溃疡，要减少溃疡的复发，尽量延长复发的间隔期，需要全身应用药物，主要目前应用的还是免疫增强剂，包括肾上腺皮质激素或者左旋咪唑现在应用比较多，能够有效的调节身体的免疫状态，能够有效的减少口腔溃疡的复发。
患有口腔溃疡和身体里面所缺维生素有一定的关系，患有口腔溃疡的情况下是可以吃鸡蛋的，只是不要吃辣椒炒鸡蛋，否则会导致口腔溃疡更加严重，一定要注意多饮水，因为多饮水能够有一定的缓解效果，还要注意多食用一些含有维生素的蔬菜和水果。
引起口腔溃疡的原因有多种。如精神压力大，劳累，睡眠不足，内分泌改变，意外受伤，缺维生素，缺锌，免疫力低下等引起的。得了口腔溃疡的患者会有灼痛感，吃东西困难而且容易反复发作。容易得口腔溃疡的患者一般以预防为主。
如果口腔粘膜的溃疡长时间不愈，应及时到正规医院或者医疗机构就医，行相关检查，以便明确诊断后对症治疗。平时应注意增强体质，减少感冒鼻塞等，补充足够的水分，清淡软食，少吃辛辣以及甜食，戒烟戒酒，按时作息。多吃蔬菜与水果。
口腔溃疡大多数的都是缺乏B族的维生素，还有微量元素导致的，也可以在日常的饮食中多吃富含维生素和微量元素的水果，蔬菜，比如奇异果，柿子，苹果等。平时还要多喝水，上火也可能造成口腔溃疡。