一般情况下，药物流产后流不干净，做清宫手术是会疼的，属于正常的反应。
清宫手术的疼痛感主要是清宫时扩张宫腔带来的，在医疗器械进入宫腔内的刮宫过程也会疼痛，因此药物流产后流不干净，做清宫手术是会疼的。在采用无痛的清宫手术后，麻药药效过后，也会有轻微的疼痛感，但是一般在可以承受的范围内。
日常生活中女性要注意多休息，坚持清淡饮食，不要吃辛辣、刺激的食物，有利于病情的恢复。
药物流产需要10-14天左右流干净。
女性在怀孕后可以通过药物流产或是人工流产将孕囊排出，如果选择药物流产的话，一般在服药后的第三天就能排出，排出时间在2-3个小时，且在10-14天才能完全流干净。如果在14天后仍然出现出血的情况，需要及时前往医院进行检查，如果宫腔内仍有残留物，需要进行清宫手术将残留物排出，避免出现感染。
药物流产是可以不进行清宫手术的，但是需要观察具体的表现，定期去医院进一步检查确诊。流产后要注意休息，注意加强营养进行调节控制，药物流产后注意保暖，一个月禁止性生活。
通常情况下，流产后没流干净一般可以通过药物、手术等方式进行治疗。
女性要尽快的清理体内的残余物质，否则会影响到子宫的收缩，从而诱发各种妇科疾病和月经紊乱。建议去医院做一下彩超，发现有少量的宫内残留物，可以口服新生化颗粒、米非司酮等。如果有大量的宫内残留物，可以进行清宫手术。手术后可以在医生的指导下口服抗生素，防止感染。
一般情况下，药物流产后是否需要立即清宫，要看病人的具体病情。具体分析如下：
通常，药物流产可以口服米索前列醇或米非司酮，在用药后会产生消化道不适、恶心呕吐、腹痛腹泻等副作用。通常使用米索前列醇后，子宫颈的柔软会促使子宫内的排泄。如果孕囊已经全部排出，可以不做清宫。如果孕囊没有完全排出，建议做二次清宫，且需要到正规的医院做个B超，了解自己的恢复状况。