不会是脑炎，儿童头痛大多为功能性疾病，也就是由于神经心理因素造成的，神经官能症性头痛、多由精神紧张、生气引起，主要症状为持续性的头部闷痛、压迫感、沉重感。建议及早先把孩子的烧退了，然后在进行头疼的治疗，因为总是发烧会引发败血病的。
孩子发烧有头痛症状，存在脑炎的可能性大。脑炎的头痛主要是颅内压升高及炎症刺激脑膜造成的；一般经过降颅压治疗头痛及精神方面会有明显的改善的。另外，脑炎除了头痛还有腹泻、腹痛、呕吐、头痛、发烧、精神差，嗜睡等症状。
脑炎头疼会持续一周左右或者两三天。
脑炎的病人如果有颅内压升高，会有头疼的感觉，这种头疼会持续多长时间取决于病人的病情，如果采取积极的药物治疗，可以缓解颅内的炎症，但是这种头痛并不会持续太久，有的病人会持续一个星期，可能只有两三天。建议患者可以及其去医院检查，因为不同的患者这种头疼持续的时间会有一定的差异。
具体没有什么头疼具体时间的长短来判断是否会是脑炎。一种为病毒性引发脑炎，比如肠道病毒、呼吸道病毒等。其他的比如细菌感染，比如杆菌状巴尔通体及该属其他种类细菌，单核细胞增多性李斯特菌等。
脑炎的头痛并没有一个固定的位置，脑炎全身毒血症状有发热、头痛、身痛、恶心、呕吐、乏力。少数有出血疹及心肌炎表现。神经系统症状表现为意识障碍，脑膜刺激征。可出现颈肌及肩胛肌弛缓性瘫痪，以致头下垂及手臂不能上举，摇摇无依。脑神经及下肢受累少见。瘫痪2～3周可恢复，约半数肌肉萎缩。轻症可无明显神经症状。
脑炎的症状一般是高热，严重的有喷射性的呕吐，还有一些阳性的体征，这样不好判断，带孩子去正规的医院儿科就诊，由医生根据症状和检查结果，指导治疗。小儿脑炎开始表现有发热，流泪，流鼻涕，双眼发红，怕光。检查可在小儿口腔两侧颊粘膜上发现白色小点，周围发红，此称为麻疹粘膜斑。