巧克力卵巢囊肿一般指子宫内膜异位囊肿。通常情况下，子宫内膜异位囊肿目前为止病因还不清楚。子宫内膜异位囊肿是指卵巢内的异位子宫内膜组织周期性反复出血，形成被卵巢实质包裹的血肿，当具有活性的子宫内膜细胞种植在卵巢局部的时候，随着每次来月经异位症的病灶，在卵巢内也会出现出血的现象，患者可以通过囊肿剔除术、囊肿穿刺术、卵巢切除术等方式进行治疗。
目前还没有专门的理论来解释卵巢囊肿的原因，但一般和遗传因素以及个体因素有关。
1、遗传因素：女性或外祖母患有卵巢囊肿的后代更容易得卵巢囊肿；
2、个体因素：正常发育时出现的良性囊性肿瘤，比如卵巢畸胎瘤。所有的患者都有不同的原因。
女性在做卵巢囊肿的时候，可以主观的触摸到附件区囊性肿物或者是包块。通过B超、彩超等检查，可以明确腹前区是否有囊性肿块，具体的可以通过磁共振和CT检查来明确。
通常情况下，卵巢囊肿出现疼痛症状可能与囊肿大小和性质有关系。如果患者患有的囊肿体积小，直径在3cm以内，通常是没有疼痛感的。但是如果囊肿持续增大，直径超过5cm，就有可能会出现疼痛感的。而且用手按压的时候，腹部可能会有压痛、反跳痛等症状。如果是生理性的黄体囊肿或者滤泡囊肿，一般会跟随月经来潮自行消失，没有疼痛感。而病理性的巧克力囊肿，可能会出现进行性加重的痛经。
一般情况下，卵巢囊肿疼痛可能是以下原因导致的：
如果一个卵巢囊肿低于5cm，就不会出现任何的症状。如果卵巢囊肿疼痛，说明是由于卵巢囊肿长的太大。当发生囊肿蒂扭曲时，会引起卵巢囊肿肿疼痛。如果是卵巢囊肿疼痛，患者可以遵医嘱口服桂枝茯苓胶囊进行治疗。如果卵巢囊肿比较大，必要时，患者可以通过手术的方式进行治疗。
卵巢囊肿是妇科疾病的一种，一般都是单侧发作的，右侧卵巢囊肿的发病原因跟女性身体内分泌失调，不良的生活方式，不注意饮食健康，以及外界环境自己有很大的关系，另外遗传因素也会造成卵巢囊肿的出现。
卵巢囊肿可以做卵巢保养的，卵巢囊肿是由于平时不注意个人卫生，不注意饮食导致的，同时要多注意休息，不要过度劳累，饮食方面多吃一些清淡的食物，不要吃生冷油腻的食物，同时要养成一个早睡早起的好习惯。