口腔溃疡的治疗以消除病因、增强体质、对症治疗为主，治疗方法应坚持全身治疗和局部治疗相结合，中西医治疗相结合，生理和心理治疗相结合。口腔溃疡常呈周期性发作，复发时间长短与口腔溃疡病史长短有密切关系。
缺少维生素B2的同时也会缺少其他的B族维生素，所以口腔溃疡还是服用相关药物B比较合适。要检查个微量元素看看，这段时间可以适当多吃一些富含维生素的青菜和水果，吃完东西后及时漱口，保持口腔卫生，注意休息，避免过于劳累。
宝宝口腔溃疡要具体情况具体分析来进行治疗。疱疹性龈口炎：主要表现为发热、发烧后出现口腔溃疡，以病毒感染为主，多数患儿高烧后出现多发性口腔溃疡，治疗以抗病毒和局部治疗为主。要找到溃疡的部位，在宝宝溃疡时，要仔细检查宝宝的口腔，找到溃疡的具体部位，再根据溃疡的部位观察对应的牙齿，有没有尖锐的牙尖儿，或者是缺口，如果有这种缺口，应当带宝宝去，医院的口腔科找医生，把尖锐的牙尖打磨光滑。
没有办法彻底的治疗好，平时注意口腔卫生，避免损伤口腔黏膜，避免辛辣性食物和局部刺激。保持心情舒畅，乐观开朗，避免事情和着急。保证充足的睡眠时间，避免过度疲劳。注意生活规律性和营养均衡性，养成一定排便习惯，防止便秘。口腔溃疡在很大程度上与个人身体素质有关，
建议使用中药进行保留灌肠，同时使用药膏和药栓塞入到肛门里面进行治疗，在药物治疗期间一定要注意多休息，避免疲劳和熬夜的情况，不要长时间的蹲厕所，在饮食上以柔软好消化的食物为主。
会引起口臭的，应该保持良好的口腔卫生状况，如果牙龈周围有牙结石或者有大量的菌斑，就应该及时的进行洗牙，保持好牙周健康。而如果牙龈周围没有见到牙结石，也应该定期的进行洗牙。