一般情况下，月经12天了还没干净可能会不孕，也可能不会，需根据患者的实际情况来判断。
月经12天了还没干净可能是月经淋漓不断的病情，如果患者在月经期间不注意保暖，会导致宫寒，从而可能会发生这种情况，患者可以在医生的指导下使用益母草颗粒进行治疗，一般可能不会导致不孕；如果月经12天了还没干净是因为妇科疾病引起的，如输卵管炎、子宫内膜炎等，建议患者及时去医院就诊，查明病因后对症治疗，这种情况下可能会影响受精卵的输送或着床，从而可能会导致不孕。
患者在月经还没有干净的情况下同房是不会怀孕的。由于患者的月经还没干净，一般说明患者还处于月经期，而由于月经期因为卵巢不会排出卵子，进入患者体内的精子无法和卵子结合形成受精卵，也就不会怀孕。但是如果是月经淋漓不尽的情况，比如说正常情况下月经是3-7天干净，如果是月经到了13一14天的时候还有少量的阴道出血，这种情况如果同房就有可能会导致怀孕。患者如果没有怀孕的打算，建议可以通过戴避孕套进行避孕，
月经不调时是不会怀孕的。
通常来讲，如果女性出现了月经不调的情况，那么就会使得排卵不正常，导致没排卵也不会怀孕。这时就需要前往医院进行检查，比如性激素六项和甲状腺激素等，了解是内分泌失调或先天性染色体异常等原因引起的，从而来进行针对治疗。
女性还可以养成良好的生活习惯，进行规律休息，保证充足的睡眠，有利于身体的健康。
宫寒的症状通常包括月经推迟，对正常怀孕有影响，但宫寒不一定导致不孕。宫寒的主要症状是体质虚弱、腰酸腿软、脚冷、四肢疲软、口淡而无味，会导致月经异常，比如经期推迟、经血颜色淡、月经量少，腰酸、腹痛、来月经前小腹坠胀、白带增多、乳房胀痛等现象，甚至还可能反胃作呕，通常月经期间或有腹痛不适，小腹发凉，月经颜色发黑或者有血块出现，这些情况可能会影响怀孕。
月经还没有干净就同房，容易诱发妇科炎症。经期的女性应该多喝热水，多观察，并且常用温水冲洗会阴部，避免着凉，穿衣服也应该注意以宽松为主，饮食上注意多吃一些富含维生素和微量元素的食物，如小米粥、鸡蛋糕、芹菜、菠菜、猕猴桃、西红柿以及绿豆芽等，不能吃油炸、腌制、熏烤的食物。如果出现尿频、尿急、尿痛的症状，通常是继发细菌感染，女性可以遵医嘱选择三金片、左氧氟沙星胶囊、呋喃坦啶片等进行治疗。
通过口服药物预防感染的。另外月经没有彻底干净，内膜是比较薄的，不适合孕卵着床，所以不会造成怀孕的，是可以放心的。还是到专业的医院做个详细的检查，看看诱发病因和详细的病症发展程度，然后再做规范性的诊疗。
