肺炎衣原体感染通常有发热、咳嗽、头痛等症状。
衣原体是临床上比较常见的致病微生物，可能累及呼吸道，进而诱发肺炎，出现发热、寒战、肌痛、咳嗽、头痛、胸痛等症状，肺部通常可闻及湿性罗音。
感染后可遵医嘱使用头孢菌素、四环素等药物，以促使局部炎症消退。
衣原体肺炎可以采用大环内酯类的药物进行治疗，也可以对症进行处理。衣原体肺炎可能会出现咳嗽、咽部声音嘶哑、咽喉疼痛、头痛等症状。可以在医生的指导下，服用止咳化痰的药物进行治疗，也可以服用清咽利喉的药物进行治疗。情况严重的采用大环内酯类的药物进行治疗。衣原体肺炎治疗期间，需要注意休息，尽量不要吃油腻的食物。
衣原体肺炎发病比较急骤，初期以发热，头痛为主，呼吸道典型症状可有咳嗽，湿啰音等，并有活动后呼吸困难，咽喉部肿胀疼痛，同时伴有捻发音，恶心和呕吐。
还有部分患者以咽炎症状出现，1~3周左右即可发展成肺炎或支气管炎等症，咳嗽加剧，并伴有可能引起肺外感染，如中耳炎、关节炎，还可合并甲状腺炎及其他疾病。
支原体肺炎和衣原体肺炎都比较严重，肺炎支原体肺炎是由肺炎支原体引起的呼吸道和肺部的急性炎症改变，肺炎衣原体肺炎多因为肺炎衣原体发病，是一种急性的肺部炎症，极容易累及到患者的上下呼吸道，可诱发咽炎、喉炎以及扁桃体炎等疾病出现。
肺炎的症状主要表现为呼吸道症状，同时还伴有全身性的表现，最主要的是呼吸道症状，就是咳嗽、胸痛、气短以及胸闷部分的患者，还会出现痰中带血的现象，严重的还会出现发热，如果出现高热的情况高达38.5以上，那么此时可能会出现肌肉酸痛、食欲不振以及头痛的情况，此时需要在医生的指导下选用合适的抗生素药物和消炎类的药物治疗，这样才能够加快病情恢复。
衣原体肺炎发病较为急骤，初期有发热、头痛等症状，还会有典型呼吸道症状，如咳嗽、湿啰音等，及活动状态下有呼吸困难、咽喉部肿胀和疼痛，并有捻发音，恶心呕吐。
部分呈咽炎征象，1~3周以后会发展成肺炎或支气管炎之类的，咳嗽加剧并可引起肺外感染等症状。例如中耳炎，关节炎，此病可合并甲状腺炎及其他疾病。