霉菌性食道炎可通过使用药物进行治疗。霉菌性食管炎主要是由白色念珠菌入侵食管黏膜，而形成的一种溃疡性伪膜性感染所致。主要是给予抗真菌治疗，胃镜发现的时候可以喷洒药物，起到杀菌的作用，而且副作用也比较小。平时不要滥用抗生素和激素药物，治疗使用中药常见有锡类散、云南白药、大蒜素等，西药常见有制霉菌素、二性霉素B、酮康唑、氟康唑、伊曲康唑等，对抗霉菌治疗均有效。
经检查，霉菌性食管炎应得到良好治疗，正是霉菌感染引起的食管炎症的表达可以通过活性抗霉菌药物得到有效改善。然而，应注意饮食中少吃腌制食品，以免加重霉菌感染。同时，可以用药物来保护胃粘膜，效果会更好。
食道炎大多在2-4周内形成临床痊愈，但停药后多可复发，所以食道炎的疗程一般在八周左右。
需要注意的是，如果患者是由于胃酸返流到食道，引起反流性食管炎的话，一般恢复的时间较长，通常需要3-4周的时间才可以逐渐恢复。同时患者应该积极注意忌食酸性，或者是辛辣刺激的食物，减少胃酸对食管黏膜的刺激，从而促进这种疾病早日恢复。
食道炎可以口服香砂养胃丸、沉香化滞丸、开胸顺气丸、宽胸利膈丸等药物来治疗。具体内容如下：
食道炎属于反流性食管炎，通常情况下，是由胃酸反流所导致的，属于较为复杂的疾病，需要结合中西医结合的方法进行治疗。西医常用的是一些具有抗酸性的药物，例如：柠檬酸铋钾颗粒、氧化铝凝胶剂等；也可以使用西咪替丁，雷贝拉唑等抑制酸性物质；还可以使用可以用来防止胃部损伤的药物，例如硫酸铝等。而中医，则通常使用香砂养胃丸、沉香化滞丸、开胸顺气丸、宽胸利膈丸等药物来治疗。
患有食道炎，患者可以吃以下饮食：
患有食道炎，患者可以少吃一些比较油腻的东西，可以吃一些富含膳食纤维的食物，比如新鲜的蔬菜和瓜果，这些都是有益于人体的营养补充。多吃些高蛋白质。食管炎的人尽量不要吃高脂食品，以免引起胃的反流性，也不要吃太多的东西，比如：巧克力、浓茶、汽水等。日常生活中要多加留意不要吃得过饱，做到七成饱。
治疗食道炎的中成药有开胸顺气丸、宽胸利膈丸、沉香利气丸等药物。
食管炎是一种很普遍的疾病，主要是由于胃酸的分泌过多引起的，主要是因为出现了烧心反酸、胸口的疼痛等症状，可以湿疣中成药，如开胸顺气丸、宽胸利膈丸、沉香利气丸，可以治疗食道炎引起的胸腹胀满、呕吐、腹痛等症状。同时建议到医院做食道镜，在医师的建议下使用奥美拉唑肠溶胶囊、克拉霉素和硫糖铝凝胶等药物进行治疗。