首先是禁食一旦发现立即禁食，轻者5～10天重者10～15天或更长，腹胀明显时给予胃肠减压，禁食期间必须静脉补液，维持水电解质及酸碱平衡营养支持，可根据培养药敏选择抗生素来抗感染，对症治疗。
要做好造瘘口护理，这个也是很重要的，造瘘口的一些相关并发症，这些都是有可能出现的，作为家属一定要做好护理，然后监测孩子的大便情况。一旦出现大便增多，甚至孩子有脱水的情况，需要到医院及时进行补液的处理，主要的就是监测体重，喂养的目的，就是让孩子长体重，早期达到二期肠造瘘还纳的条件。
新生儿坏死性小肠结肠炎是多种致病因素导致的以腹胀、呕吐及便血为主要表现的急性坏死性肠道疾病。总体发病率0.3%-2.4%活产婴儿，约90%-95%的病例发生于早产儿。该病病情一般较严重，病死率高达50%。
新生儿坏死性小肠结肠炎的表现轻者可有腹胀、呕吐、腹泻或者便血，重者伴有全身非特异性的败血症，其他可有呼吸暂停、心动过缓、嗜睡、休克等感染中毒现象，早期可以胃排空延迟之后出现腹胀，严重的还可出现呕吐及消化道出血。
新生儿坏死性小肠结肠炎特征是在小肠远侧和近端处，常见的是早产婴儿和足月婴儿，男性多于女性。
一般在出生后2-3个星期内出现，首先是腹部肿胀，其次是恶心，其次是有胆汁或咖啡渣样物质；最后是大便和大便，可以是鲜血、果酱样和黑色，x光检查可以显示出小肠胀气，肠道形状坚硬，肠腔增粗，肠道腔内积气体，门脉气体。在进行治疗的时候一定要严格的禁食，在没有出现呕吐和腹痛症状的情况下，如果出现了进食的情况，就可以进行手术。
一般来说，新生儿坏死性小肠结肠炎需要通过以下途径进行治疗。
出现新生儿坏死性小肠结肠炎的情况，一旦确诊应当给禁食，禁饮食期间还应当遵医嘱给予葡萄糖脂肪乳、氨基酸等药物进行静脉补液，从而帮助维持水电解质和酸碱平衡。然后在医生的指导下使用第三代头孢菌素进行治疗。对于病情较为严重，甚至出现休克组长的新生儿，还应当在医生的指导下使用血浆、低分子右旋糖酐等药物来输注平衡盐溶液液。对于出现穿孔腹膜炎的新生儿，还需要考虑进行手术。
