慢性咽炎的治疗主要针对病因，如戒烟戒酒，积极治疗急性咽炎及鼻腔、鼻窦、扁桃体的慢性炎症，改善工作和生活环境，避免粉尘及有害气体的刺激。如果患慢性肥厚性咽炎，咽部异物感明显时，可采用分次激光、冷冻或电灼治疗。
慢性咽炎引起的口臭，应找到原因，对症治疗。由鼻窦炎、扁桃体炎引起的慢性咽炎，发生口腔异味时，清热解毒药物治疗后，气味可逐渐消失。萎缩性或干燥性咽炎，可使用养阴生津药物，调节气血运行，从而消除口臭。
慢性咽炎可以导致咽部黏膜、黏膜下及淋巴组织的弥漫性慢性炎症，但不会引起颈部及下颌的淋巴结肿大。对于治疗咽部黏膜的淋巴结肿大，可以使用中药成分的含片，以清咽利嗓类的为主。
慢性咽炎不会引起颈椎病，因为咽炎属于炎症的反应，炎症刺激咽喉部，就会出现明显的水肿，疼痛，并且在吞咽时有明显的不适感，但是颈椎病是不会引起炎症的反应的，只是导致颈部的神经，血管受压，引起颈，肩，背部疼痛并且伴有头痛。
感冒后，容易诱发支气管炎，导致咳嗽咯痰。如果支气管炎比较严重，通常会有痰液形成。干咳则提示支气管炎比较轻。可以食用相关药物，还可以配合食疗，喝点蜂蜜炖梨或者炖白萝卜，也有止咳化痰的效果。有咳嗽的时候要注意戒烟，少吃辣椒。
感冒引起的咳嗽可以在医生的指导下使用感冒药物和止咳祛痰的药物来进行治疗。如果咳嗽的症状比较严重，可以使用雾化吸入来缓解咳嗽的症状，感冒一般是由于病毒或者是细菌感染所引起的上呼吸道病症，主要伴有流鼻涕、打喷嚏的症状，严重者还会出现四肢肌肉酸痛和发烧的症状，病毒感染引起的感冒，一般都有自限性，七天左右就可以痊愈。如果是由于细菌感染引起的感冒，可以使用抗生素药物进行治疗，在患病期间，患者要注意饮食清淡，不要吃辛辣刺激，容易上火的食物。