治疗念珠菌性阴道炎可以选择单纯性VVC的治疗，可局部用药，也可全身用药，主要以局部短疗程抗真菌药物为主。全身用药与局部用药的疗效相似，毛巾和内裤要进行充分消毒，煮沸15分钟，并要放在阳光下晒干，平常也应放在通风、干燥的地方。
念珠菌性阴道炎也称霉菌性阴道炎，是由念珠菌感染引起。其发病率仅次于细菌性阴道病，这种病主要是用口服消炎药和直接上一些消炎的栓剂，如果在配合中药调理好的会更快了。
单纯性的阴道炎，局部用药一般就可以了，也就是第1次发病的时候，一定要按疗程彻底的治疗，复杂性的也就是重度的霉菌性阴道炎，需要在第1次治疗的基础上，然后再巩固1个疗程，也可以用口服的治疗霉菌的药物，如果是霉菌性阴道炎也就是1年内有4次以上的复发，这种阴道炎治疗是比较麻烦的。在第1次治疗彻底以后，然后再巩固治疗半年。每个月月经干净后用1个疗程的药物。
念珠菌性阴道炎连续治疗三周后基本恢复正常，治疗期间不要性生活，避免发生交叉感染。平时穿棉线宽松透气的内衣不要太紧身，养成良好的生活习惯，不要有多个性伴侣，避免感染性病。
用碱性溶液如2~4%碳酸氢钠或肥皂水冲洗外阴及阴道，改变阴道酸碱度，使不利于霉菌生长，冲洗后，再用制霉菌素片剂或栓剂塞入阴道内，每次10万~20万单位，每晚一次，10~14天为一疗程，外阴再涂以3%的消炎药，效果可更好。
如果只是在显微镜下发现了阴道念珠菌菌丝，没有任何的不适反应，并不需要进行任何处理。一般情况下，可以通过外用药膏来进行调理，但由于念珠菌性阴道炎的病情不同，治疗方法也不尽相同。如病人为复杂的念珠菌感染，一般需用药物超过2个疗程。妊娠期间有念珠菌感染，可以使用少量的外用药物，这样会更保险一些。
女性复发型的阴道念珠菌感染一般一年发生4次或4次。