小儿推拿的治咳穴位有肩颈穴、肺腧穴、中渚穴等。
1.肩颈穴：用双手从肩颈穴开始沿肩胛骨骨缝从上向下推拿，有助于镇咳，通常适用于小儿治咳。
2.肺腧穴：位于第三胸椎下凹陷旁开1.5寸处，用手指指腹按揉5分钟，有宣肺通气、改善肺功能等功效，所以适用于小儿推拿治咳。
3.中渚穴：中渚穴位于无名指，能疏风解表、化痰止咳，小儿如果存在咳嗽，可以适当推拿。
小儿推拿是建立在祖国医学整体观念的基础上，以阴阳五行、脏腑经络等学说为理论指导，运用各种手法刺激穴位，使经络通畅、气血流通，以达到调整脏腑功能、治病保健目的的一种方法。推拿的方法有很多，包括直线方向，旋转方向，垂直方向等，它们共同的补泻原则是：顺经方向推为补，逆经方向推为泻，来回推为平补平泻。
如果孩子太小，在孩子身上按摩不会有止痛的症状，除非是孩子的局部病变或身体内部器官的疾病，按摩时相应的按摩部位会有疼痛，但一般按摩后会有舒适的表现，所以如果孩子有局部疼痛，可能是由于过度操作造成的局部肌肉韧带损伤。
用手在小儿体表的穴位或其他部位施加物理性刺激，以激发小儿机体自身的调节，从而纠正经络的偏差，调整小儿的脏腑功能，增强机体的抗病机能，以达到防病治病的目的。
小儿推拿通常可以治疗肠炎。
肠炎是由于细菌、病毒、真菌或者是寄生虫等一系列的因素而引起的一种肠道的炎症，包括小肠的炎症和结肠、直肠的炎症。小儿推拿属于中医的一种治疗方法。小儿推拿可以治疗肠炎，轻度小儿肠炎可以通过小儿推拿来治疗。如果是脱水严重、水电解质紊乱、感染严重的小儿肠炎，除了小儿推拿外，还要配合西医药物治疗。