可服用益生菌帮助建立肠道内的正常菌群，促进消化。也可以服用小儿健胃消食的药物或者顺时针按摩宝宝的腹部，促进胃肠道的蠕动，缓解消化不良的症状。如果已经添加辅食，要减少辅食的添加。
新生儿母乳喂养在三个月内的大便都可能出现蛋花样大便或水样便等情况，也是正常的现象，与孩子肠内毒素未排干净和母亲的饮食过油腻等有关系。如果是新生儿的话，可以不做处理，注意观察，如果是四个月以上的孩子，出现腹泻，要考虑药物干预，用些调节肠道菌群和功能的药物。
新生儿肠胃发育不成熟，消化能力差，喝母乳消化不良也是正常的。
新生儿有消化不良的现象，母乳的妈妈要注意饮食，不能吃凉的、刺激性的、太油腻的食物。喂宝宝前要清洁乳头。注意喂养时间要节制，不能新生儿一哭就喂奶。妈妈要注意保持营养均衡，要摄取糖类、蛋白质、脂肪、维生素、矿物质等营养素，注意钙质和铁质的补充。
纯母乳喂养宝宝消化不良，可以通过减少母乳喂养量或者服用药物等缓解症状。
1.减少母乳喂养量。纯母乳喂养出现消化不良，主要是由于过度喂养所引起的。在消化不良期间，需要注意减少母乳的喂养量，通常可以缓解症状。还要注意母亲的饮食，尽量避免辛辣、油腻的食物。
2.服用药物。如果消化不良的症状比较严重，可以在医生的指导下服用药物改善症状，比如益生菌等。
纯母乳喂养的小孩出现消化不良时，建议在医生的指导下采取治疗的措施。期间要让孩子多喝水，多给孩子按摩腹部。
可用益生菌帮助建立肠道内的正常菌群，促进消化。也可以服用健胃药物或者顺时针按摩宝宝的腹部，促进胃肠道的蠕动，缓解消化不良的症状。如果已经添加辅食，要减少辅食的添加。
宝宝消化不良可以通过改善生活方式、调整饮食结构、药物治疗等方式来调理。
首先，可以多做游戏和有氧运动，促进肠胃蠕动和消化，改善消化不良。建议每天保持一定的运动量，促进身体发育，促进肠道消化，养成良好的排便习惯。其次，消化不良可能与进食过多、消化不良有关，建议减少进食量，少食多餐，定时定量进食，避免食用辛辣油腻的食物。日常生活中多吃富含维生素、纤维素的水果、蔬菜，如苹果、香蕉、芹菜等，纤维素能促进肠道蠕动，促进肠道的消化。如果长期消化不良，可以口服乳酸菌素片、枯草杆菌二联活菌肠溶胶囊、胰酶肠溶胶囊、神曲消食口服液等药物治疗。儿推拿、中药敷贴、推拿、按摩等也可调理脾胃功能。