脑脱髓鞘又叫中枢神经系统脱髓鞘，大多数情况下都不能有效的治疗，早期可以口服波尼松、地塞米松等药物，并能促进大脑的新陈代谢，促进血液循环。脑苷肌肽，长春西汀，脑蛋白水解物，奥拉西坦，吡拉西坦等都是提高脑代谢的有效药物。常用的药物有丹参酮、维脑路通、疏血通等。脑桥中心髓鞘溶解症、同心圆性硬化、多发性硬化是脑脱髓鞘病变的主要原因。
通常来说，脱髓鞘改变处理方法如下：
如果是轻微的脱髓鞘变化，不需要特别的处理，出现症状可以通过口服强的松、地塞米松等糖皮质激素来缓解病情。如果是重度的中风，可以采取一些积极的活动，防止出现关节的僵直和其它的并发症，适当的应用抗生素等，同时要定时进行检查。
需要注意的是，平时要注意避免过度劳累，不要进行重体力劳动或者剧烈运动，饮食以清淡为主，有利于身体健康。
一般情况下，炎性脱髓鞘可以采用以下方式及进行治疗：
炎性脱髓鞘主要由外周神经脱髓鞘及中枢脱髓鞘组组成。吉兰巴雷综合征是炎性脱髓鞘的主要病因，而多发性硬化症则是以其为主。在急性期时可以遵医嘱口服泼尼松、地塞米松等药物进行治疗。如果出现严重的情况，可以使用大剂量的甲强龙，给予短暂的冲击。还可以口服维生素B1、维生素B6、腺苷钴胺、甲基钴胺等药物进行治疗。平时注意保暖，尽量不要受凉。
如果是缺血性脱髓鞘，轻微的病变是不需要特别处理的，但如果出现了头晕、认知障碍等症状，可以口服一些改善循环、营养神经的药物，例如：胞磷胆碱钠胶囊、贝前列腺素钠片、尼麦角林胶囊、尼莫地平片、奥拉西坦胶囊、银杏叶片等。急性播散性脑脊髓炎以多发性硬化、视神经脊髓炎、急性播散性脑脊髓炎为主。炎症性脱髓鞘的治疗在急性期可以选择大剂量的激素，也可以是丙种球蛋白，在症状消失后可以口服免疫抑制剂或干扰素来维持。
脱髓鞘疾病分为炎症性脱髓鞘和缺血性脱髓鞘。炎症性脱髓鞘的治疗要针对病因，大多数需要使用糖皮质激素，其主要作用是抑制炎症反应、防止脱髓鞘进一步加重。使用营养神经的药物，促进髓鞘修复和再生。缺血性脱髓鞘要以改善微循环、活血化淤为主，营养神经的药物使用和炎症性脱髓鞘基本相同。
一般情况下，该病的治疗主要包括免疫干预治疗和对症治疗。具体内容如下：
免疫干预治疗常用的药物为糖皮质激素类药物，临床上一般应用甲波尼龙，波尼松。必要时也可应用干扰素，免疫抑制剂，单克隆抗体，也可应用血浆置换疗法。对症治疗常用的药物有巴氯芬以缓解痛性痉挛，尿潴留时可以应用卡巴胆碱，疲劳感严重时可以应用金刚烷胺，震颤明显时可以口服苯海索等。
确诊后，患者在治疗期间注意清淡低盐饮食，尽量避免吸烟饮酒，减少高蛋白、高热量、刺激性、生冷食物的摄入。