临床所见口腔溃疡大多为复发性口腔溃疡，因为局部疼痛，影响饮食、语言等会给生活带来很大的困扰，所以有口腔溃疡后应该及时治疗，减轻症状。其治疗原则是消除致病诱因，增进机体健康，减轻局部症状，促进溃疡愈合，但是目前还没有特效药物，所以治疗时应针对每个病例的致病诱因和对药物的反应，有侧重地采用治疗方法和药物。
口腔溃疡可以通过药物进行治疗。口腔溃疡的治疗方法主要是祛除病因、增强体质、对症治疗，坚持全身治疗与局部治疗相结合，心理治疗与生理治疗相结合。口腔溃疡的局部可以使用喷雾剂或者西瓜霜局部适量的外用，同时要祛除口腔内的不良刺激因素，比如残冠、残根、不良修复体等。还要注意保持口腔清洁，每日正常刷牙、漱口，多吃水果、蔬菜，保证机体所需要的营养及微量元素。还要注意心理健康，时刻保持心情愉悦，不能有过大的心理负担。一般情况下，一周左右口腔溃疡即可愈合。建议去口腔科进行检查，根据诊断结果对口腔溃疡进行治疗。日常生活中应该注意口腔的保养，多吃一些清淡的食物，防止上火。
口腔溃疡可以饮食清淡易消化一些多喝水，口服一段时间维生素改善症状。口腔溃疡是口腔科常见的黏膜性疾病，可反复发作。口腔溃疡与自身免疫状况、周围环境、水土情况及自身遗传因素有关。
出现口腔溃疡需要补充维生素。口腔溃疡可能是精神因素导致的口腔溃疡、病毒感染造成的口腔溃疡需要是抗病毒治疗，创伤造成的口腔溃疡，烫伤造成的口腔溃疡，有针对性的进行补充。
口腔溃疡的治疗主要是促进愈合，减少复发。促进愈合的治疗，主要有两个方面，一是预防感染，可以含漱抗感染的漱口水。二是促进黏膜修复，局部应用生长因子喷雾剂贝复剂，副作用较小效果好。特别是深大溃疡，长期不愈合的效果肯定；促进黏膜修复也可以局部应用激素，激素副作用较大，不能长期使用。减少复发，主要是西药调理免疫功能，中医中药辩证调理。局部减少创伤，防止形成溃疡。