临床上多主张患儿在2岁以内治疗，部分心室缺损患儿可用介入疗法来替代外科的开胸手术。多数室间隔缺损病人应尽早手术治疗，年龄以1－7岁为好，尽可能于10岁以前手术，以免出现严重肺动脉高压而失去手术机会。平时避免孩子哭闹，以免加重心脏负担和病情。
通常情况下，先天性胎儿有心室间隔缺损，一般会在一年之内自动关闭。具体内容如下：
但是如不能自己封闭，或是单纯的二孔导致先天性心脏缺损，应做外科治疗，4~5岁是最好的选择。尽早进行外科治疗，可以避免肺部的循环阻力增高，避免右心功能衰竭。此外，宝宝还需要进行一次心脏的超声检测。如果没有明显的扩大，或者低于6mm，可以不做手术。患儿要饮食清淡，多食新鲜蔬菜、水果，补充维生素，提高身体免疫力。营造舒适、安静的休息环境，定期通风，保持室内空气新鲜，避免上呼吸道感染。
胎儿先天性心脏病的治疗方式主要取决于先天性心脏病的类型。
可选择介入治疗，这主要是根据完备的机器设备和优化的专业技术操纵病症。但微创技术多只是针对主动脉狭窄，动脉导管未闭的畸型少年儿童。因为选择介入治疗时病发症偏少，即便不选择开胸医治，也能够及时修复。现阶段传统式开胸手术与消融手术紧密结合，右胸口开2到3cm小口，再放入消息推送器，具备防空隙的作用。
先天性心脏病可以通过使用药物、进行手术等方式进行治疗。
1.使用药物：对于先天性心脏病，患者可以在医生的指导下使用呋塞米、地高辛等药物进行治疗。治疗期间，患者应当多休息，不要进行过于剧烈的运动。
2.进行手术：先天性心脏病患者在必要时，还可以在医生的指导下通过室间隔缺损封堵术、先天性心脏病纠治术等手术的方式进行治疗。
一般情况下，先天性心脏室间隔缺损可以通过以下方式进行治疗：
先天性心脏室间隔缺损，是一种在胎儿发育过程中，由于心脏的不完整而引起的一种先天性心脏病。可能出现气促、呼吸困难、多汗、乏力、反复感染等症状。如果是轻微的，没有什么特别的表现，可以通过日常的饮食和常规的检查来改善。如果是在初期有心脏功能不全的情况下，建议做手术治疗。
先天性心脏病遗传治疗方法有介入治疗、外科手术等。
先天性心脏疾病会导致发展缓慢，智力低下。对于动脉导管没有闭、房间隔缺损、局部室间隔缺损等情况，可以采用介入治的方式进行处理。此外，对于诸如室隔缺损、心脏病伴发的肺血管压迫等，也可以采用外科手术的方式进行治疗。
患者还要多吃蔬菜水果，避免暴露在辐射以及其他有害的环境中，还要定期进行复查和健康体检。