色素痣存在恶变的情况，但是在临床上恶变的可能性非常小。
每个人的身上都可能会存在色素痣，且随着年龄的增加，色素痣的数量也会逐渐增多。一般无需特殊处理。只有色素痣比较大，或者在颜面部。影响到了患者的美观，此时就可以选择激光的方式进行改善。通过高能量的激光照射色素痣，色素细胞吸收热能后坏死，随着皮肤的角化，坏死的组织被新生组织取代，从而达到很好的治疗效果。
可以采用激光治疗的方法。激光去除色素痣做法是首先用药物擦洗治疗部位，消毒，然后用激光作用于病变皮肤，传输的能量会在瞬间使组织里的水分气化，同时带走有色素的皮肤组织，而不伤及周围健康组织。但是如果面积较大的色素痣，而且颜色比较深，就需要采用植皮的治疗方法。
眼角长色素痣一般并不用治疗。
眼角有色素痣，一般是不影响眼睛的正常功能的，提出不需要治疗。色素痣如果影响了眼睛的正常功能，可以考虑是由于黑色素痣的面积很大，或者是有增大的迹象需要手术治疗，。另外，如果色素痣的体积太大，可以通过移植皮肤，或局部皮瓣来进行相应的处理。这样既能在术后达到更好的效果，又能在眼角术后保持更好的状态。
色素痣通常要做体格检查、组织活检等，具体分析如下：
1、体格检查：需要观察皮肤痣的颜色、范围、大小，以及有没有出血、溃破等情况，还要触诊痣的质地、硬度、活动度等。斑疹、丘疹，直径在6毫米以下，呈不规则的对称分布。另外，体检也能与其它疾病相区别。
2、组织活检：在色素痣切除术后，对组织切片检查，以确定是否存在恶性或有可能发生癌变，这对色素痣的诊断及鉴别诊断具有重要意义。
脸上长色素痣可能是色素沉着、黑色素瘤等原因导致的，不同原因可采取不同的治疗方式。
1.色素沉着：长时间在户外活动的人，由于紫外线长时间照射，可能会由于黑色素沉着在脸上后，进而长色素痣。建议可以通过戴防晒帽、涂抹防晒霜等方式来减少紫外线的照射。
2.黑色素瘤：黑色素瘤是黑色素细胞来源的一种高度恶性的肿瘤，患者如果患上了此病，脸上可能会突发新生的黑褐色斑片或者斑块，患者还可能因为其黑褐色斑片以为长的是色素痣。患者可以在医生的指导下使用注射用达卡巴嗪、替莫唑胺胶囊、紫杉醇注射液等药物进行治疗。
色素痣可以通过液氮冷冻的方式进行去除。
色素痣主要是人体皮肤基层内黑色素沉淀过多，导致堆积，出现黑色、深褐色的色素痣。液氮冷冻治疗主要是通过液氮的冷冻能力，将皮肤内层的黑色素细胞组织进行瓦解、破坏，使色素形成水疮，随着自身的代谢排出体外，从而达到去除色素痣的效果。
日常生活中出门需要做好防护措施，涂抹防晒霜、防晒喷雾，穿戴防晒衣、太阳镜等，也需要避免摄入色素过多的食物，例如：咖啡、酱油等食物，避免体内黑色素沉淀，加重色素痣。