通常情况下，皮下囊肿不会自行消退。
皮下囊肿是生长在皮肤部位的一种良性肿瘤，是否会消除要根据皮下囊肿的类型与囊肿的大小。如果皮下囊肿较小，可能在受到外力的刺激会自行溃败，随时间推移，囊肿会逐渐消退消失。但这种可能性比较小，大多数情况都不会自行消退的，如果是较大的皮下囊肿，一般都要经过手术治疗才能消退。因此，皮下囊肿能否自行消退，与囊肿的类型与大小有关。
皮下囊肿可能会癌变，但概率极小。
如果皮下囊肿患者有囊性畸形，那么恶性的可能性较大，一般都是良性的。皮下囊肿切除后需要做好组织切片检查，主要是皮脂腺囊肿，皮样囊肿，皮样囊肿等。通常情况下，头部、面部、筋、躯干等都需要外科手术，如果不是感染或者囊肿，可以完全切除。局部皮肤要不要切掉，要看与周边的肌肤情况。当然，部分缺损的皮肤是可以避免再次出现的，这要看其体积，如果是比较大的，可以尽可能的保存周边的肌肤。
皮下囊肿好发于头皮、颈部及臀、背部，是一种真皮内含有角质囊肿。系因外伤将表皮植入皮下而成。其囊肿壁为上皮结构，但基底细胞层为囊壁外层。角质层为囊壁内层并充满角质物于腔内，及时的挂个皮肤科，症状体征确定是否是皮下囊肿。
皮下囊肿为良性的属于外科疾病。如果囊肿较小，可以定期复查的，如果要除根需要行手术切除的治疗。避免刺激，越刺激长的越快，要在感染前外科手术治疗。在感染前进行手术治疗将囊肿可以完整的剥离出来，如果囊肿表面已经有波动感说明已经合并了感染，手术不易剥离完全，残留的囊肿壁可以复发的。
皮下囊肿指表皮以下的部分出现的囊性肿瘤。表皮以下处于真皮的浅层，通常由于皮肤附属器的一些组织变异而形成的特定的囊性肿瘤，比如皮脂腺囊肿。皮脂腺囊肿是在临床上比较常见的一种囊肿，内容物通常是皮脂腺分泌的皮脂，类似于豆渣一样半固体状态的物质，囊壁实际上是一种皮脂腺的组织结构。除了皮脂腺囊肿，在皮下还有一些像汗腺囊肿，或者其他一些如毛母质瘤，出现的这种囊肿样的症状，跟汗腺有点相似的。
