在怀孕初期孕酮指标偏低，这主要是由于胎儿不稳定引起，体内的孕激素水平偏低，所以很容易出现先兆流产，或者是停胎情况的发生。就要及时补充孕酮，避免发生先兆流产的问题，孕酮低，的原因目前也不是十分清楚，但是一般通过补充治疗之后，多数都是有效的。
孕期出现孕酮低，主要跟体内孕激素水平偏低、卵巢黄体分泌不足有关。孕酮偏低会直接影响到胎儿的健康，严重时会出现流产、早产的情况发生，尤其是孕早期。进入孕中期以后孕酮的值多数会处于比较稳定的状态。
孕酮过低一般是因胎儿发育不正常所致。
孕酮是从卵巢黄体中分泌出来的天然孕激素，孕酮能保持正常范围内的正常妊娠。先兆流产或宫外孕，均容易影响卵巢黄体对孕酮的分泌。所以在怀孕之后如果发现孕酮偏低的话，就需要先排除宫外孕，有先兆流产问题的话，同时会有胎心。也可以补充黄体酮来提高身体的孕酮水平。如果孕酮能恢复到正常水平，胎儿仍可保留。
最常见的原因是妊娠黄体功能不全，是因为妊娠以后黄体产生的孕酮太少，这时候如果不能及时补充孕酮，就容易影响到胎儿的生长发育，甚至可以导致胎儿生长发育停止，出现流产和死胎。
妊娠早期孕酮偏高，与其自身的黄体功能不全有关，也有一些原因是胎儿的品质不好，或者是自然流产。在没有做B超的情况下，是不是子宫内孕，黄体酮低于15.9ng/ml，说明是宫外孕。hcg和孕荷尔蒙都很低，是因为受精蛋着床部位的营养条件不好。
在日常生活中，饮食营养要均衡，多吃新鲜的蔬菜和水果，适当的运动，比如慢走、打球等，有利于身体的健康。
怀孕后孕酮如果数量偏低，那么就需要警惕流产，也就是胎盘位置不好或者卵巢功能不良，如果选择打针也没有太大的改善，那么就是本身数量缺乏比较严重，需要继续使用这个黄体酮孕激素来进行补充。