脑部核磁共振没有电离辐射，对人体没有放射性的损害。其中脑部核磁共振是利用人体内氢质子，在磁场中产生共振信号来获得的图像。脑部的核磁共振对颅内的检查能够更精确，同时脑部核磁检查不会出现颅骨的伪影，也不需要造影剂，就能够清楚的显示头部冠状位、矢状位等图像。
宝宝做脑部核磁共振对宝宝的脑部发育是有影响的。磁共振有射线，对身体有一定的伤害，但如果只是偶尔一次也没什么，应该先到儿科就诊，根据医生对孩子的全面检查决定是否需要做此项检查。
核磁共振是通过核磁共振来检测人体的内脏，不会产生辐射，所以不会对人和大脑造成危害，甚至连婴儿都不会造成危害。核磁共振的时候，身体要保持平稳，正常的扫描要20分钟，如果要做X光或者做血管造影，则要花费更多的时间，所以，宝宝只能在睡觉的时候做，或者是在睡觉的情况下使用镇定剂，这样才能让手术成功，影像清晰，结果也更加可信。
在早产儿出生后和两岁时对他们进行核磁共振，可以了解婴儿脑白质状况。科学家通过核磁共振技术，定期扫描婴儿脑部的图像，并且将这些图像进行对比。就能发现早产儿是否有脑白质的损伤，如果没有就能确定婴儿的大脑发育基本正常，而如果脑白质发生了损伤，那么早产儿脑很可能会出现脑瘫、认知延迟以及视觉或听觉障碍等脑部疾病。
脑部核磁共振不能查脑供血不足，可以通过脑部核磁共振观察颅内血管走形及各级分支，观察血管有无畸形，有无狭窄，闭塞等。脑供血不足，需做个脑血管造影才能明确的。
婴儿进行核磁共振通常是没有明显危害的，可以在医生指导下正常进行，无需特别处理。
对于婴幼儿来说，核磁共振是一种非常安全的检查方法，是一种使用高场强磁场进行检测的仪器，通常不会对人体造成任何的伤害，在临床上是一种常用的检查方法。但是磁共振检查耗时较久，噪声较大，婴儿可能不能配合检查，要先进行镇静。需要注意的是，当通过磁共振发现幼儿患有某些疾病的时候，最好是可以尽快的进行治疗，并且在选择药物的时候也应该要慎重。