小儿先天性直肠肛门畸形疾病没有什么特效药物治疗，主要就是进行手术治疗。可以去当地公立医院儿科门诊，小儿先天性直肠肛门畸形疾病世一种先天性的发育畸形而导致的，容易出现在小儿身上。
先天性直肠肛门畸形就是患儿的直肠和肛门部位出现畸形了，例如先天性肛门闭锁就属于以上畸形的一种了。先天性直肠肛门发育畸形非常多见，并且类型众多，直肠盲端和瘘管的位置各异。其发病率在新生儿中为1∶1500～5000，占消化道畸形的首位。可以根据检查的结果看看是不是需要手术进行治疗。
先天性肛门直肠畸形是新生儿期最常见的消化道疾病，其病因和胚胎发育机制目前尚未完全明确。先天性肛门直肠畸形，从最轻症的膜状肛门到严重的泄殖腔畸形。前者仅需简单手术能达到良好的手术效果，后者手术操作难度大，费时，尽管能重建肛门，但术后仍存在排便、排尿及性功能障碍，部分新生儿因肠梗阻或伴发的疾病需要做紧急处理。
可能会导致排便不畅，甚至引发内脏出现压迫性疾病，及时将检查结果交给肛肠科的医生与肛肠科医生沟通，具体治疗方案配合医生进行治疗，日常生活当中饮食避免辛辣刺激的食物。尽量以流质食物营养丰富，有利于营养的补充。
一般情况下，婴儿先天性足畸形的症状首先内翻足型。在站立时，脚掌内翻，跟腱也发生了内倾。其次是马蹄足，它的脚掌是用来站起来的。还有是外翻足型，其临床症状与内翻足型的不同。也可能是仰趾足，在站立和走路的过程中，只有脚跟才能接触到地面。或者是弓形足，其特征是足底有过度的纵弓，以及扁平足多趾症等。建议婴儿先天性足畸形及时前往医院，在专业医生的指导下进行治疗。
先天性足畸形的原因通常是遗传因素、环境因素、产伤、宫内窘迫等，具体内容如下:
先天性足畸形可能是由基因、染色体异常引起的。染色体异常是一种常见的疾病；环境因素，妊娠期间吸烟、饮酒、接触化学污染物等，都有可能造成先天性足畸形；新生儿出生时，如果挤压不当，造成产伤，都有可能造成先天性足畸形；如果胎儿长期处于不正确的位置，也会引起先天性足畸形。
