前列腺脓肿晚期用手术治疗，途径有经膀胱、膀胱外、经会阴、经直肠等多种，常由于暴露欠佳致手术切除不完全，复发率高、并发症多，青年人慎用，对于年轻人，保留精阜对正常射精至关重要。
前列腺脓肿晚期是不提倡进行手术治疗的，提倡保守治疗，对症治疗，采用有效的传统中药保守治疗，中医中药长期临床实践积累了许多非常有效的治疗方法。减轻病人痛苦，延长生命。平时需要加强运动、增强体质，禁吃辛辣酒、生冷等刺激性食物。
西医治疗前列腺脓肿多从药物、手术及物理治疗等方面入手。抗菌药物的应用要达到足量，以求短期内控制病情。穿刺抽脓术前列腺脓肿一般宜采用会阴部或经尿道镜前列腺穿刺抽脓术。经会阴部前列腺切开排脓适于脓肿明显增大，不能自行引流到尿道或向尿道破溃病人。经直肠前列腺切开排脓术适用于前列腺后叶周围脓肿。局部治疗通常采用热疗。
可以采用药物治疗，尿道排脓或者会阴部切开排脓加抗生素。或者是外科治疗，反复进行，容易操作，损伤小。术后也要进行定期复查。平时饮食上也要多注意，少辛辣，多吃点可以增强体质的食物。
前列腺囊肿属于常见病，不需要治疗的，注意日常调理是重点，避免过度性生活和手淫，少食辛辣刺激性食物，少烟酒等，多食新鲜水果，蔬菜，粗粮及大豆制品，多食蜂蜜以保持大便通畅。多喝水，勤排尿，注意休息，加强运动，避免受凉，不要久坐，不骑车，不憋尿。
可以在进行检查后，使用一些抗菌的药物进行消炎治疗。也可以采取会阴部前列腺穿刺抽脓术，配合使用中套辅助治疗，或者切开排脓术。也可以物理疗法，用热水袋放在会阴部做热敷，促进局部脓肿炎症消散。