治疗灰指甲通常需选用抗真菌药物来进行。因指（趾）甲生长较慢，角质层比较厚，治疗时间会比较长，因此治疗时一定要保持耐心，足疗程规范用药。
若患者指（趾）甲出现不规则变形的表现，一般需在用药前将变形的指（趾）甲修挫掉，再外用抗真菌药物，如亮甲复方聚维酮碘搽剂。亮甲是治疗灰指甲的专用药，所含聚维酮碘、阿司匹林等成分可起到杀灭甲下真菌、抑制真菌再生、消炎止痒、加快药物渗透的作用，患者可按疗程并足量用药，能较显著地改善指甲变形、变色、翘起、糟碎、脱落等症状。不过需注意，如患者有多个指（趾）甲都已出现病变，则可在外用药物的同时，遵医嘱与口服抗真菌药物搭配治疗，如特比萘芬、伊曲康唑等。
由于灰指甲治疗周期较长，故用药方面需注意规范，不建议患者采用民间偏方或土方治疗，可能会加重病情或延长治疗时间，对患者的健康造成损害。
灰指甲即甲癣，也叫甲真菌病，是由皮肤癣菌、酵母菌等真菌引起的指（趾）甲感染疾病，该病的治疗通常可通过抗真菌药物来进行。
灰指甲患者可使用含有抗真菌药效成分的外用或口服药治疗，常见为聚维酮碘、特比萘芬、氟康唑、伊曲康唑等。轻症患者可直接通过外用药物来改善病症，如以聚维酮碘为主要成分的亮甲复方聚维酮碘搽剂，该药不仅含有杀菌抑菌的聚维酮碘，同时还含有阿司匹林成分，能够在患处分解为水杨酸，起到消炎止痒、加快药物有效成分渗透的作用。若患者症状比较严重，也可与口服抗真菌药物进行联合治疗，可发挥较显著的疗效。
需注意的是，患者需基于自身病情，结合医生指导规范用药，不可盲目使用，以免加重病情。
灰指甲不治疗会导致感染的整个指甲毁损，还容易传染给周围的人。灰指甲不治发展到末期，将会使指甲和甲床分离，失去指甲后生活会很不方便，不仅如此，灰指甲是真菌病的传染源，不仅会传染给自身和身边的人，甲真菌也可随着搔抓而接触到身体其它部位，发生各类皮肤癣，女同志患灰指甲可传染致阴部形成霉菌性、白念珠菌性阴道炎等妇科病；病甲处容易并发细菌感染，使病人发生丹毒或蜂窝组织炎等全身症状严重的疾病。应该尽快到医院就诊，可以涂擦抗菌的药膏，还可以配合口服抗真菌的药物，平常也可以用点醋兑水来泡脚，还可以通过手术拔除病变的指甲。
外用药物可以有一定的疗效，但疗程长，要有长期坚持治疗的耐心，手指甲有灰指甲一般外用药物最少三个月。想治好灰指甲可以采用外用加内服的办法，用药一周休息三周为一个疗程。一般需要3个疗程。用药期间密切监测肝功能。
孕妇可以治疗灰指甲。
灰指甲是一种常见的真菌性疾病。在临床中如果孕妇发生了灰指甲，也是可以进行治疗的。但由于患者处在一个比较特殊的时期，在灰指甲治疗期间，往往只建议其应用外涂的抗真菌药物，并不建议患者应用口服的抗真菌药物。最常用的就是阿莫罗芬、碘酊等来进行外涂的治疗。如果要口服药物来进行治疗，应在医生的指导下进行治疗，如果有不良情况应及时前往医院进行检查。
灰指甲容易治疗与否，通常与患者甲部病情、治疗方式的选择有一定联系。轻度灰指甲患者，外用抗真菌药物后可见病情好转；而中重度灰指甲患者，治疗难度较大，建议外用药物期间，搭配口服抗真菌药物，能够取得较好的疗效。
灰指甲是真菌感染引起的甲部病变，在发病初期，患者可直接通过外用抗真菌药物来治疗，如亮甲复方聚维酮碘搽剂，可杀灭患处的致病真菌，抑制致病真菌繁殖，有效改善轻度灰指甲患者指（趾）甲变色、变形、翘起甚至脱落等症状。当患者病情较重时，常需在外用抗真菌药的基础上，联合口服抗真菌药进行治疗，有助于增强药物杀菌、抑菌效果，帮助患者改善灰指甲的症状。但需注意，中重度灰指甲患者的治疗周期较长、难度较大，建议遵医嘱足量足疗程用药。