不存在扁平疣的最佳治疗方法，较好的治疗方式是冷冻治疗、药物治疗等。
1、冷冻治疗：扁平疣是由人乳头瘤病毒感染皮肤黏膜所引起的良性赘生物，是疣的一种，冷冻治疗是利用液氮将局部组织快速冷冻起来，破坏组织细胞，使皮损部位坏死或是脱落，直至疣体去除。价格为1000-3000元/疗程，恢复期为1个月左右，恢复后可以化妆和护肤，具体价格受到地域消费水平、医院级别等因素的影响。
2、药物治疗：患者可以在医生的指导下使用鬼臼毒素软膏、咪喹莫特乳膏、氟尿嘧啶乳膏等药物来治疗，这些药物可以抑制培养的正常人皮肤角质形成细胞，避免病情发展。
一般情况下，扁平疣是一种人乳头瘤病毒感染导致的皮肤病。具体内容如下：
不注意个人卫生、病毒感染等原因可能导致患者出现扁平疣，这是一种人乳头瘤病毒感染导致的皮肤病，患者可以及时前往正规医院，在医生指导下使用维A酸乳膏、重组人a-2b干扰素乳膏等药物进行治疗，如果情况严重，还可以前往正规医院，通过液氮冷冻、激光烧灼来治疗。
扁平疣是由人乳头状瘤病毒（HPV）感染引起的，好发于青少年的病毒感染性疾病。可突然起病，皮损多发于面部、手背、手臂，临床表现为皮色或粉红色的扁平丘疹，无明显的自觉症状，部分患者自觉轻微瘙痒。病程慢性，可通过直接或间接的接触传染。
可通过直接或间接的接触传染。对于扁平疣，扁平疣是由于扁平疣病毒感染所导致的出现扁平疣，可以通过激光或者冷冻。去医院皮肤科用二氧化碳激光进行治疗，也可以用液氮冷冻进行治疗。
扁平疣的最佳治疗方法是皮下埋入术。皮下埋入术是一种有创性的治愈，能够让身体产生一些对于人类乳头瘤病毒的抗体，使身上已经生长的扁平疣自行的吸收或者脱落。