婴儿咖啡斑是不会自行消失的。
许多婴儿在出生后可能会出现咖啡斑，并且不同的患者也会有不同的症状。有的咖啡斑的颜色更深，边缘更清晰，面积也更均匀，使用激光进行治疗效果更好，通过多次激光治疗后，大部分患者都能得到根治，甚至有的时候使用激光也无法达到预期的效果。婴儿出现咖啡斑要到医院检查，建议到皮肤科进行检查，具体的治疗方法和时间要结合婴儿的具体情况。有的婴儿年纪太小，可以等他们长大了，再来治疗。
婴儿咖啡斑可能在出生时就有，也可能在幼年时发病，主要症状是皮疹。
皮疹呈淡褐色或深褐色，像咖啡和牛奶混合的颜色，所以也叫牛奶咖啡色，咖啡斑也叫牛奶咖啡斑。形状不一，呈现圆形、椭圆形或是不规则形，直径大小不一，大概1.5cm-15cm。随年龄增长皮疹数量可能增多，面积变大，不能够自行消退。在躯干、四肢或其他的部位发生。
咖啡斑的治疗主要包括激光治疗、家庭护理等。
1.激光治疗：咖啡斑是一种较常见的色素沉着性皮肤病。激光治疗咖啡斑的原理是利用激光的光电效应将皮损内的黑色素进行破坏，从而达到治疗的作用。
2.家庭护理：平时要注意保持卫生，加强皮肤清洁，避免过度摩擦搔抓。平时要注意防晒，避免阳光直射，外出可戴太阳帽或打太阳伞，外用防晒产品。
咖啡斑多数需要治疗，具体根据自身实际情况诊断。
咖啡斑颜色比较浅或者面积较小，多数不会导致美观受到影响，不需要特殊治疗，但要做好防晒，不能受到强烈紫外线照射，以免导致颜色加深或者面积增大。如果咖啡斑比较严重或者咖啡斑面积比较大，会对面部美观造成很大影响，还会打击到个人自信心，因此需要治疗。
去除咖啡斑可选择激光祛斑，利用性光热原理瞬间爆发巨大的能量，作用于色素组织，能够将色素击碎或者分解，被巨噬细胞吞噬掉，从而可以随着自身淋巴系统排气排出体外，达到祛斑作用。
咖啡斑是一种先天性色素沉着性皮肤病，常见于新生儿，具体分析如下：
咖啡斑是在出生时或出生后不久发现的褐色斑块，多发于面部和躯干，呈散在分布。咖啡斑的斑块大小不一，形状不同，界限清楚，可随年龄增长而增大、增多。咖啡斑还可能会随着年龄的增长有所消退，一般无需进行特殊处理。若咖啡斑影响到了外在美观，可以进行冷冻治疗。该方法是通过冷冻液态氮作用于咖啡斑表面，令局部组织在瞬间被冷冻，使表皮色素细胞坏死，以达到去斑的目的，效果可维持2~3年，具体时间因人而异。
婴儿咖啡斑会自行消除，婴儿咖啡斑主要是遗传因素导致的局部出现咖啡色斑片，不凸起皮肤，是一种胎记。该种疾病如果想要治疗，可以选择在孩子两岁以后在进行治疗，因为两岁之内很多咖啡斑处一个不稳定期，就算是选择治疗手段把他去除了，有可能会再一次扩大，治疗方面。