一般卵巢囊肿这种疾病是不会影响排卵的。具体情况分析如下：
卵巢囊肿主要是长期慢性炎症刺激，导致卵巢的腺管堵塞之后，不能很好的分泌液体，从而形成的一种肿块。大部分卵巢囊肿都是良性病变，因此对患者的内分泌影响不大，不会使得患者出现排卵减少，或者是不排卵的情况，但是卵巢囊肿可能会压迫到局部的肌肉组织，引起腹部疼痛，所以建议患者及时治疗。
由于全身性疾病，导致的女性的排卵障碍。如重度营养不良、过度肥胖或者是饮食中缺乏某些维生素，平时应该少食多餐等，注意不要有压力等，同时建议配合b超等检查看一下卵泡的情况，积极配合促排卵的药物等调理看一下，但是积极减少剧烈活动即可的。
一般情况下，卵巢囊肿患者可以通过医学检查、手术治疗等方式进行治疗。具体情况分析如下：
如果是直径在5cm以下的卵巢囊肿，同时检查CA125、CA19-9、CEA、AFP等指标是否在正常范围内，可以在月经结束后进行妇科彩超检查。如果是一个直径超过5cm的卵巢囊肿，同时还要做妇科彩超检查。卵巢囊肿外科治疗通常是对有需要或尚未绝经的妇女，应行腹腔镜下摘除或剖腹切除。如果是绝经期后的妇女，或者是因为有恶性肿瘤的原因，需要进行手术治疗。
卵巢囊肿一般都是由于有附件的炎症，或者是有子宫内膜异位症导致的。中医来讲，是由于卵巢周围有寒湿，血瘀导致的，所以治疗起来一般都是活血化瘀，祛寒湿。另外遗传性加上饮食不当，内分泌失调，也有可能引起卵巢囊肿。
严重的卵巢囊肿建议尽快手术给与治疗，并且在月经干净三天到七天做手术，手术之前可以抽血检查妇科肿瘤三项来了解癌胚抗原癌肿抗原是否异常，患者可以选择腹腔镜手术，无论是哪种方式都建议在手术后将切除的肿瘤送病理给予化验。
如果是在手术过程中发现或者怀疑囊肿有恶性变，建议做病理切片给予诊断，再在以上的指导下决定手术范围。
一般情况下，女性卵巢囊肿处理方法，具体分析如下：
如果是单纯的囊肿，直径超过五厘米，建议进行外科治疗。一旦确诊为实心肿瘤，立即进行外科治疗，通常都是通过腹腔镜进行的，可以做腹腔镜下的囊肿摘除手术。
平时女性要注意保持良好的作息规律，多喝温开水，多吃新鲜的瓜果蔬菜，还要注意保暖、多休息，有助于身体健康。