通常在怀孕10-13周）进行，也可以在怀孕14-24周通过羊水进行。亲子鉴定是运用医学、生物学和遗传学的理论和技术，通过分析儿童和父母的形态结构或生理功能的相似特征，分析遗传特征，来判断父母和孩子之间的关系是否属于自己。
怀孕四个月羊水充足，这时候可以通过羊膜腔穿刺，抽取羊水做DNA鉴定，也就是常说的亲子鉴定。如果时间更早，因为羊水比较少，穿刺起来有些困难，也有可能会损伤到胎儿。怀孕时间更晚，羊水量充足，可以在超声波定位下穿刺抽取，操作起来比较简单，也不会影响到胎儿。
怀孕四个月就可以进行亲子鉴定了。
在孕妇怀孕三个月以后，羊膜腔内的羊水就会逐渐形成，四个月时月时羊水基本充足，这个时候就可以进行羊膜腔穿刺，通过抽取羊水进行DNA鉴定。最好是在四个月后才进行羊膜腔穿刺，因为过早的话，羊腔膜内羊水比较少，所以穿刺起来会比较困难，而且也有可能会对胎儿造成伤害。所以一般建议最少在四个月以后进行。
通常情况下，怀孕期间可以做亲子鉴定，一般在孕4-8个月比较适合做。
具体来说，亲子鉴定主要有两个方面：羊水亲子鉴定绒毛膜亲子鉴定。
1.羊水亲子鉴定：首先要做的是，抽取羊水，从羊水中抽取脱落细胞，用试剂提取DNA物质，然后与男子的DNA进行比对。
2.绒毛亲子鉴定：一般在怀孕八周后进行，需要提供母亲的样本进行绒毛检测，然后提取样本细胞核中所含的DNA，再进分析。担忧已孕初期胚胎发育不成熟，绒毛穿刺易引发流产，一定要在正规医院，由专业医生进行检查。
备孕是一件技术活，想快速怀孕并非是件容易的事儿。首先要到医院排除阻碍怀孕的因素，接下来就是抓住快速怀孕时间安排“做功课”啦。在排卵日前后1天安排同房，采用好的受孕姿势，做足事后保精措施。
40岁怀孕通常必须做羊水穿刺，因为35岁以上的时候，胎儿染色体异常的发生率就会明显增加。胎儿染色体异常最准确的方法就是羊水穿刺，羊水穿刺是判断胎儿染色体异常的诊断金标准。通过穿刺抽取羊水，进行染色体的核型分析，了解胎儿是否有染色体异常，是不是必须做羊水穿刺也不一定。随着外周血无创DNA的技术开展，有的孕妇可以通过外周血DNA检测来判断胎儿是否有染色体异常。