巧克力囊肿是不会影响怀孕的，但是怀孕后由于体内激素的原因可能会导致囊肿增大，要定期到医院去复查，应该是把巧克力囊肿先治疗好，再受孕比较好，同时要注意休息。清淡饮食为主。
妊娠流产后不孕的概率很低，不要太紧张。孕妇两年前做过流产，但是如果孕妇没有采取避孕措施，也没有怀孕，那么孕妇需要夫妻双方都去医院进行全面检查。影响不孕的因素很多，夫妻双方都可能导致不孕，所以只有在检查清楚之后，孕妇才能找出原因并给予正确的治疗。
巧克力囊肿约25%病人无症状，有症状者表现下腹痛、继发性痛经进行性加重、不孕等，该疾病不孕率高达40%。新婚，未生育，有生育要求，巧克力囊肿大小5厘米，建议手术治疗，因术后复发率高，所以术后要尽早备孕，术后可以到正规医院生殖中心进行指导备孕。
进行任何一次引产后都有可能造成继发性不孕，或是习惯性流产，而人流次数越多，不孕的可能性越大。此外，出现输卵管炎或输卵管阻塞也可能导致不孕。不要以为引产只是小手术，对身体影响不会太大。实在不然，多次人流引产对子宫及身体都有一定的损害，严重会导致不孕。
通常来说，引产两次可能会导致不孕，也可能不会。
引产是指妊娠12周后，因母体或胎儿方面的原因，须用人工方法诱发子宫收缩而结束妊娠。根据引产时孕周，可分为中期引产（14～28周）和晚期妊娠引产（28周以后）。而在进行了两次引产后，如果手术比较顺利，通常不会导致不孕，但如果手术不顺利，引发炎症，引起子宫内膜炎、阴道炎或盆腔炎，则可能会导致不孕。
