三个月婴儿拉稀首先考虑是感染肠炎了，是一种消化功能紊乱的综合征，给孩子喝一些调节孩子肠道的菌群，同时也要给孩子多喝水，保证孩子体内充足的水分，避免孩子造成脱水的现象，注意孩子的保暖，避免孩子受凉加重病情，也要注意让孩子在饮食上做到少量多餐，避免孩子消化不良引起高烧，注意室内温度和湿度的适宜，充分保证宝宝的休息。
不会影响到宝宝，可以继续母乳喂养。但是如果一些母亲是有比较严重的腹泻性疾病、感染性疾病，像细菌性痢疾或者是某些特殊的病毒感染，暂停母乳喂养，可以暂时进行人工喂养。
这有可能是有肚子受凉或者是有病毒感染引起的这种表现，注意观察，如果感觉症状比较明显，或者是宝宝有明显的脱水症状，应该及时去儿科进一步检查。查明原因然后用药。
一般来说，宝宝拉肚子母乳喂养要注意以下事项。
宝宝拉肚子母乳喂养多给宝宝多饮水，避免出现缺水的情况，如果出现了肠道炎症，需要在医生的指导下口服抗炎药物，可以缓解病情，平时家长多给宝宝做一些腹部的推拿。
家长应该让患儿注意休息，保持环境安静，饮食宜清淡、易消化、富含营养，适当到户外活动，加强体格锻炼，增加抗病能力。
一般情况下，宝宝拉肚子可以采取以下办法推拿。具体分析如下：
小儿腹泻之后，可以采用按摩的方法进行调理，效果会更好。具体来讲，推拿方法主要有：一种是顺时针方向的按摩，一次5-10分钟。第二步是在小儿的天枢、神阙上按摩，分别按摩五分钟。第三步是为儿童按摩背部，一次按摩9-15次。第四个步骤是给龟尾巴按摩，每次按摩5分钟。通常可以采用上述四种方法进行止泻。
母乳喂养的宝宝拉肚子的情况，可能是由于着凉的情况导致的，或者是母乳出现了问题。在这段时间内给宝宝注意腹部的保暖，尽量避免着凉。然后平时一定要注意饮食安全，多喝水。