新生儿拉肚子可以用抗炎药治疗。治疗上主要是减少喂奶的量和喂奶的次数。因为有消化不良或者是肠胃功能紊乱导致的情况，还是跟妈妈的饮食有关系的。妈妈要注意避免辛辣刺激油腻生冷的食物以及不易消化的食物。
宝宝大便呈蛋花样水样便，主要由于病毒感染引起的病毒性腹泻。病毒性腹泻一般都发生于秋冬季节。是由于感染轮状病毒引起的。可以服用抗病毒和中和的药物治疗，如果次数比较多，一定要到当地的医院去诊断清楚病因治疗。
孩子拉肚子拉水样的大便，可能和着凉了有关系，也有可能是消化不良。可以给宝宝服用点药物控制，室内的温湿度适宜，温度不要太低，注意观察宝宝体温变化。可以多给孩子做腹部热敷，注意腹部保暖，保持饮食规律。
新生儿拉肚子分感染性和非感染性两种情况，因为新生儿的肠道粘膜屏障功能差，进食不规律或者在受凉的情况下，很容易有腹泻的表现。新生儿拉肚子会出现腹泻次数增多,次数比原来要多,大便的性状会稀,大便中会有奶瓣、黏液、血丝等。
建议取新鲜大便做常规检查，如果是感染性因素，需要用敏感的抗生素治疗，如果消化不良，服用助消化药物，注意腹部保暖。
一般情况下，新生儿拉肚子可以通过药物治疗、生活护理来改善，具体内容如下：
首先要明确引起婴幼儿腹泻的病因，包括生理性腹泻、感染性腹泻和不感染性腹泻三大类。母乳哺育的宝宝一天的大便次数多在7-8次，或者10次左右，宝宝的排便量很少，只要宝宝精神好，吃奶好，体重增加也是可以的。如果孩子出现拉稀，要做好排便检查，如果是不良性的，可以通过饮食调节、调节肠道菌群类药物、肠粘膜保护剂、补液等药物进行对症处理。感染性痢疾、肠炎等是以肠炎、痢疾为主要特征的。过敏性痢疾要给予宝宝特别的喂养。
先去查电解质和心肌酶谱，排除电解质紊乱脱水以及累及心脏。可以适当地用湿巾或者是温水把屁股清洗一下。如果还在加重的话及时就诊。要谨防宝宝发烧，多留意宝宝的精神状态。