复发性口腔溃疡的主要病因并不明确，但是科学文献证明，它与以下几种原因存在相关性：1、与患者的精神因素有关，如果患者的心态不好、工作压力大、心理负担重，很有可能会患上这一类的疾病。2、与患者的休息有关，如果患者的工作繁忙、睡眠不足，很有可能导致这类疾病的发生。
可能是由于体内虚火旺盛，自己的身体长时间处在一个上火的状态，比如长时间的熬夜，作息不规律，一直爱吃辛辣刺激的食物，久坐不运动等原因都可能使自己体内虚火旺盛，长口腔溃疡。还有一种可能是身体内缺乏微量元素，比如铁、锌、各种维生素等，身体免疫功能降低或者营养不良，增加口腔溃疡发病的可能性。
是复发性口腔溃疡。免疫因素，细胞免疫异常，自身免疫异常，体液免疫异常，也有可能是免疫功能低下或者是免疫缺陷。胃肠道疾病、遗传因素、微量元素铜、锌缺乏和维生素缺乏，微循环障碍，精神有创伤。
此病常见的诱发因素有：压力大、精神高度紧张、经常熬夜、便秘、胃肠消化不良等，另外女性月经前后和更年期体内激素会有变化，故当女性月经不调时候或者更年期也易多发本病。此外该病还与遗传、身体免疫力低下、内分泌失调、体内缺乏某种微量元素如锌等有关。
缺乏维生素B，缺乏维生素B是引起小孩口腔溃疡的主要原因，小孩缺乏维生素B会引起患上的疾病就是口角炎、唇炎、舌炎等口腔炎症。(2）体内多寒热。体内多寒热也是引起小孩患上口腔溃疡的一个原因，小孩大量食用高热量食物就会导致身体出现心脾过热，从而引发小孩患上口腔溃疡这个疾病。
经常性口腔溃疡的原因是缺乏维生素或微量元素缺乏、营养不良、吃油腻油炸、辛辣刺激性食物导致上火出现口腔溃疡或者是长期服用西药时间长，容易产生副作用和抗药性，不重视口腔溃疡，没有注意饮食和口腔卫生问题，导致口腔溃疡。