这可能与矮小症有关，矮小症指儿童的身高低于同性别、同年龄、同种族儿童平均身高的2个标准差，每年生长速度低于5厘米者。特发性生长障碍、染色体异常、宫内发育迟缓、先天性骨骼异常发育、内分泌疾病以及长期慢性疾病等均可导致。要结合血常规，生长激素，甲状腺激素等综合判断。
一般情况下，5周岁男孩身高100公分是属于矮小症的范畴。
因为正常此年龄段男孩的平均身高大约在111公分左右，矮小症儿童的身高低于同性别、同年龄、同种族平均身高两个标准差，每年生长速度低于五公分。在这种情况下，就要给孩子及时的查找身材矮小的原因，常见的原因如遗传原因、营养不良、营养过剩、性早熟、生长激素分泌不足等，需要明确病因后对症治疗。
小孩挑食，低于同龄儿童两个标准差属于矮小症患者。
矮小症是指儿童挑食导致营养不良，儿童身高低于同龄儿童身高两个标准差。是指同种族、同性别、同龄个体身高低于正常人群平均身高2个标准差或低于3个标准差者。需要做血液检查，如性激素、生长激素、甲状腺激素等。也可以做脑部核磁共振检查，看看是不是脑部垂体肿瘤导致孩子矮小。找出矮小的原因，采取积极的治疗措施。家长这一时期需给孩子补充维生素和微量元素，并结合医生建议进行积极治疗。
宝宝个子矮小，日常要注意调整饮食，鱼肉蛋牛奶及新鲜蔬菜水果要均衡摄入。多到户外活动，可以增强体质，同时也可促进身高增长。如有贫血，缺钙缺锌等要及时纠正。宝宝身高与遗传有一定关系，与生活环境，营养及内分泌也有一定关系。
小孩子如果比较爱挑食可能会导致营养不良影响身高的，多吃一些富含蛋白质、钙质和新鲜的蔬菜水果补充各种维生素。要多做一些跳跃性的运动能够帮助长高的。多做一些喜欢吃的食物，不要吃一些垃圾食品或者刺激性的食物。也要保证充足的睡眠，才能够有利于生长激素的分泌帮助长高的。
营养不良、甲状腺功能减退等都是导致身高矮小的主要因素，患者应对因进行治疗。
1、营养不良
营养不足会对骨头的生长造成一定的影响，从而引起身高的矮小。平时要多食用富含蛋白质和钙的食品，比如奶制品、豆制品、瘦猪肉、鱼肉、虾皮等，还要多食用一些新鲜的水果和蔬菜，这些都是可以帮助人体吸收所需要的营养物质，从而帮助骨头的发育，从而提高个子。
2、甲状腺功能减退
甲状腺功能减退会对身体的发育造成一定的影响，从而造成身高的矮小。可以在医师的建议下口服甲状腺激素来辅助生长。