少精不育的治疗首先应该明确引起少精不育的病因，需要针对病因进行治疗，生殖系统感染需要抗炎治疗，静脉曲张可以通过手术治好的，抗精子抗体阳性可以用免疫抑制剂等，如无法明确病因可以采取丙酸睾丸酮治疗。
男性不育病因很多，包括睾丸功能受损、睾丸萎缩、精索静脉曲张、前列腺炎、附睾炎以及过去患腮腺炎继发睾丸病变、输精管炎输等，输精管梗阻、输精管堵塞等。
男性不育这类病人一定要到男科就诊复查，精液质量在检查器官功能时排除做阴囊彩超可判断睾丸质地密度、精索静脉有无曲张等。如确认精索静脉曲张的存在，则可手术及输精管畅通与否，如不畅则行手术以消除梗阻。
男性不育通常是因为自身的睾丸机能障碍导致的。
如果是因为病毒性的睾丸炎或是细菌性睾丸炎，会损伤到生精小管，从而会对精子的生成造成一定的伤害。还需要考虑到精子的输精管阻塞，从而影响到精子的排泄。如果不能生育，建议到男科做阴囊彩超，并做睾丸穿刺，确定是不是因为生精小管自身的疾病。还要做一下输精管造影，看看有没有通畅，可以针对具体原因采取相应的措施。
导致男性不育的疾病主要为甲状腺功能亢进症等。
还有甲状腺功能减退、隐睾、睾丸炎、睾丸扭转、精索静脉曲张、勃起功能障碍、射精功能障碍、前列腺炎等疾病。通常可分睾丸前后三部分。通常男性应该保持健康、乐观向上的生活态度，禁烟、禁酒、忌食辛辣刺激性食物、切忌憋尿、久坐和长期骑自行车、骑马等，应该加强体育锻炼，避免暴露在高温和不利于精子生长的环境中，这都能保护男性生育能力。
性功能障碍是引起男方不育的原因之一。而射精过快或一般认为的早泄，是性功能障碍中射精障碍的一种。射精障碍影响生育，主要是因为不射精或逆行射精，无法通过自然性爱将精液送入女性生殖道。其实，多数早泄并非不育的原因，但有一种情况例外，那就是严重的原发性早泄。这类射精反射过度敏感，一有性活动或性刺激立刻就会射精，此时，阴茎可能还没进入阴道了，更谈不上精子进入女性生殖道。
男性不育病因众多，达数十种之多，甚至有人认为，理由多达数百条，可导致男性不育。
男性不育可分先天性和后天性，则若先天遗传，这就是所谓先天性，具有后天影响，称为后天性，有的人同时大家也能按，对男性不育有作用环节，分睾丸前因，也有睾丸原因，也有睾丸后方的病因，不论出于何种考虑，不管是哪一个环节，只要对精子发生和成熟产生影响，其存活和排泄情况，任何一环都会受影响，均能引起男性不育，因此男性不育，不是一个单一的疾病，却是一种综合征，一种综合征是由多种病因引起的，诸多环节都受影响，均会发生男性不育。