一般情况下，慢性结肠炎的患者要在四诊合参的基础上，明确病因，对症治疗。具体分析如下：
通常来讲，对于脾肾阳虚型的慢性结肠炎，可以口服固本益肠丸；如果是脾胃虚弱的慢性结肠炎，可以口服补脾益肠丸；如果是肝脾不和引起的慢性结肠炎，可以口服固肠止泻丸；肠炎宁片是由大肠湿热引起的慢性结肠炎；如果是脾胃虚寒引起的慢性结肠炎，可以口服小建中颗粒等。需注意的是，所有药物要在医生指导下服用。
慢性结肠炎通过及时治疗和调理，不会发生癌变，但是不积极配合治疗或饮食不注意，病情会加剧且容易复发。结肠炎可因细菌、真菌、寄生虫、病毒等感染引起，要注意休息，避免疲劳，避免着凉；保持情绪乐观，尽量避免负面情绪。
慢性结肠炎存在细菌感染，还应当根据病原菌选择敏感的抗菌药物进行治疗，常用的药物有喹诺酮类、氨基糖甙类等。临床上缓解症状最常用的药物是柳氮磺吡啶、美沙拉嗪等。如果慢性结肠炎出现急性改变，这时还可以考虑短期应用糖皮质激素，如地塞米松、泼尼松等。此外还应对症治疗，腹痛明显时可以应用山莨菪碱；腹胀明显时可以应用莫沙比利；腹泻明显时可以应用盐酸洛哌丁胺；便秘症状明显时可以用果导片等。
临床用药还应当正规合理，以最大限度的控制症状发作。如果慢性结肠炎存在细菌感染，还应当根据病原菌选择敏感的抗菌药物进行治疗，常用的药物有喹诺酮类、氨基糖甙类等，比如左氧氟沙星。临床上缓解症状最常用的药物是柳氮磺吡啶、美沙拉嗪等。
应该进一步的调整饮食习惯，尽量的吃一些清淡的容易消化的食物，避免吃辛辣刺激的食物，一般这种疾病多数和自身的免疫功能有很大的关系，也和平常的饮食习惯有关系的，一般通过调整应该是能够慢慢改善的，但是这种病是比较难治好的。
是指多种原因引起的结肠炎症性病变，可由细菌、原虫等生物引起，亦可由变态反应及理化因子引起，根据病因不同，可分为特异性炎性病变和非特异性炎性病变，前者指感染性结肠炎、缺血性结肠炎和伪膜性结肠炎等。后者又称炎症性肠病，包括溃疡性结肠炎及结肠克罗恩病。患者一般会有腹泻、腹痛、黏液便及脓血便、里急后重、大便秘结等表现，常伴有消瘦乏力等，多反复发作。