胆囊结石且胆囊萎缩应该手术治疗，因为胆囊结石的癌变率大概10%，当胆囊出现萎缩的时候，说明胆囊的功能就不健全了。这时候胆囊既然没有功能，里面又有大量的结石，这样引起癌变几率比较大。
一般来说，胆囊结石的检查包括以下几种：
1、多普勒彩超：胆囊内结石能清晰的显示出来，结石的发现率高，而且是无创性的，费用低，是临床上首选的检查方法。
2、CT或MR：若不能确定是否是慢性胆囊炎或急性胆囊炎，应做CT或MR，但CT或MR检查比较昂贵，不能作为常规的检查。
3、X光：胆囊结石中有一些是胆固醇性结石，X光不能显影，不易发现，因此在临床上很难找到。
胆囊结石的治疗措施包括：
1、静止型胆囊结石，在无明显临床表现的情况下，只要注意饮食和定期复查即可；
2、胆囊炎复发、嵌顿、填塞、慢性胆囊炎、癌变等，都要进行外科手术；
3、轻度胆固醇性胆囊结石，对消化有一定的影响，可以选择药物；
4、如果结石不大，胆囊功能良好，可以采用经皮内窥镜取石，但目前尚未得到广泛的应用。
产妇胆囊结石通常可以使用药物来治疗，在产后行手术。
如果怀孕时有胆囊结石，通常不能做胆囊切除手术，因为胆囊切除术是要做全身麻醉的手术，这样会对怀孕产生一定的影响。建议在产妇在生产后再进行外科手术。如果怀孕期间因胆囊结石而出现胆囊炎，可应用抗生素或利胆的药物来控制感染，如感染持续时间过长，且已临近产期，则应在取出胎儿后进行胆囊切除，以控制病情发展。
一般情况下，胆囊结石3-5mm通常需要治疗。具体分析如下：
如果胆囊结石是单发的，而且小于3cm的胆管结石，一般不会有太大的临床表现，通常暂时不用治疗，平时应该注意适当地饮水即可。如果胆囊结石是多发的，而且已经有3-5mm，可能会嵌顿在胆囊颈部，会导致急性胆囊炎、胆囊穿孔、坏疽等并发症，这种情况下患者需要及时就医治疗，以免病情加重，严重损伤身体健康。
胆囊结石可能是以下原因引起的。
胆囊结石是由多种原因造成的，不管是什么原因造成的，都会导致胆汁的酸性、胆固醇的代谢紊乱，从而导致胆汁在胆囊内沉积，从而导致胆囊内的结石。肥胖、长期暴饮暴食、高脂肪、高蛋白饮食、高脂血症、糖尿病、胃肠道手术、肝硬化等都属于高风险的危险因子。另外，一些年轻人因为不喜欢吃早饭，导致胆囊中的胆汁滞留太久，导致了胆囊结石的发生。