通常情况下，卵巢囊肿出现疼痛症状可能与囊肿大小和性质有关系。如果患者患有的囊肿体积小，直径在3cm以内，通常是没有疼痛感的。但是如果囊肿持续增大，直径超过5cm，就有可能会出现疼痛感的。而且用手按压的时候，腹部可能会有压痛、反跳痛等症状。如果是生理性的黄体囊肿或者滤泡囊肿，一般会跟随月经来潮自行消失，没有疼痛感。而病理性的巧克力囊肿，可能会出现进行性加重的痛经。
附件囊肿小腹是会有胀痛的感觉的，严重的可能会导致月经失调，白带异常等问题的，要是出现病情要积极的配合治疗，平时要注意局部的卫生情况，不要过度的劳累，平时要调整好作息，少吃刺激油腻的食物，饮食应该要清淡为好。
出现肝囊肿的期间会引发疼痛现象，并且会导致刺痛的症状，引发肝囊肿之后都应该护理好个人的身体，并且应该做好冲刺工作，这样都可以帮助更好的消肿，也可以防止损害自己的肝脏，而且在这个阶段更应该吃消炎消毒药物，这样都可以帮助缓解疼痛。
如果肝囊肿不是很大并且不会压入肝脏和周围的气管，就不会有疼痛。可能与肝囊肿没有任何关系。如果疼痛明显，建议到医院进行额外检查，以排除胆囊炎，或者是由12指腹溃疡等因素引起的。还可以了解肝囊肿的表现是否更高。
卵巢囊肿是不会引起腹痛的。但特殊的情况下，如卵巢囊肿蒂扭转会引起剧烈的腹痛。卵巢囊肿蒂扭转多发生于瘤蒂较长的，活动度良好的肿物。突然改变体位时容易发生蒂扭转，一旦确诊后要尽快手术治疗。
卵巢囊肿是有可能引起腰痛的，也有可能腰痛是卵巢囊肿的主要症状。出现腰痛要及时治疗，也可以复查一下囊肿的情况，同时还要警惕是否有其他妇科炎症，或是腰肌劳损等引起的腰酸痛。