有口腔溃疡，应该先于医院就诊，检查口腔内是否有致使口腔黏膜破溃的残冠、残根、不良修复体等局部刺激因素，并且去除，进行系统治疗，如果不去除局部刺激因素，会导致反复的口腔溃疡，长期刺激甚至会导致口腔癌的发生。然后，口腔溃疡局部可以使用口腔炎喷雾剂或者西瓜霜外用，并且多吃水果、蔬菜及高蛋白的食物，补充人体所需的营养，增强抵抗力。
经常引起口腔溃疡，需要检查免疫力情况，微量元素是否缺乏，通常是全身治疗加上局部治疗。局部治疗主要是以消炎止痛，促进溃疡恢复为主，可以使用消炎药物进行治疗。对于频繁发作且病情较重的病人，可考虑全身治疗减少复发和促进恢复。
导致口腔溃疡的原因包括，损伤性原因：包括物理性损伤、化学性损伤等，如食物刺激、化疗、咬伤等，感染性原因：包括细菌感染、病毒感染等；消化系统疾病；疫功能减低：如疲劳、熬夜、情绪波动等。
口腔溃疡是局部创伤食物药物、营养不良、激素水平改变以及维生素和微量元素缺乏系统性疾病，免疫疾微生物在口腔溃疡发生。由缺乏微量元素，铁锌，缺乏叶酸，维生素B12以及营养不良都会导致口腔溃疡。
因为病因存在个体差异，倡导消除病因，增强体质，对症医治。同时可以含盐水。盐水可以消毒杀菌，不像外用消毒水没有不可吞食的成分，所以口腔溃疡期间经常含盐水可以起到抑菌的作用，加快伤口愈合的速度。