扁平疣1-2年，扁平疣分布面积小，颜色与肤色接近或略显深色。3-6年，扁平疣分布面积逐渐增大，颜色成浅咖啡色或深咖啡色。6年以上，扁平疣颜色成灰褐色，表皮有角化不全和角化过度，颗粒层可增厚，乳头瘤样增生，真皮乳头增宽，呈外向型生长。
祛扁平疣一般需要通过激光的方法来进行治疗，也可以通过冷冻激光来进行改善。激光主要是通过光热效应直接作用于病灶组织，可以使病灶组织细胞坏死和脱落，从而达到永久性祛除的效果，并且不会对正常的皮肤或者是皮下组织造成影响。冷冻激光主要是通过低温冷冻使病灶组织细胞坏死。恢复期间一定要注意好皮肤的护理工作，尽量避免揉搓或者是抓挠，饮食上也要减少辛辣性的食物摄入，可以多吃新鲜蔬菜或者是水果。
常规去除方法有激光冷冻等办法以及外用茶剂这些方法。只能去除疣体。扁平疣是由病毒引起的，单纯的去除疣体对清除体内病毒没有什么意义，不去根。目前有一种技术（DNA生物序列重组疗法）一周左右可以去除掉，费用也便宜。
治疗方法有以下两种，药物治疗：西医治疗扁平疣一般多会以药物为主，药物治疗扁平疣多从抗病毒、增强免疫功能方面下手。激光治疗：是目前治疗扁平疣比较常见的一种方法，激光治疗扁平疣在临床有较大优势，激光治疗的方法可以作用到疣体基底，被黑素颗粒吸收，使之凝固破裂和气化。
扁平疣平时可以食疗薏米粥来调理，平时也可以服用抗病毒的药物对症治疗，还可以服用中草药代茶饮调理，也可以外用药物治疗，具体需要看看病情选择合适的治疗方案方法，平时需要戒辛辣油腻刺激性食扁平疣平时可以用珍珠麦片粥食疗调理，平时也可以用抗病毒药物对症治疗。也可以用金银花、蒲公英等中草药代替茶饮料进行调理，也可以用外用药物进行治疗。平时，要避免辛辣、油腻和刺激性食物，多吃蔬菜和水果，补充各种维生素，平衡饮食，适当锻炼，提高体质物，多吃蔬菜水果，补充多种维生素，均衡饮食，适当运动，提高免疫力。