口腔溃疡一般一到两周可以自愈，如症状较重疼痛明显，可以口服消炎药物及漱口液漱口，补充维生素C，饭前用漱口液漱口止痛，食物以微温或凉的流质为主，超过两周仍不愈合，建议到正规口腔门诊就诊检查。
口腔溃疡癌变比较严重，可能会表现成口腔溃疡还有癌性溃疡。手术只能切除看得见的肿瘤，对于残存在血液和淋巴中的癌细胞无能为力，所以术后也要做好巩固治疗，以防复发和转移。
口腔溃疡尽量不食用西瓜，西瓜水分较大，富含维生素很多，但是会使口腔溃疡病情加重。在溃疡发作的时候不能吃刺激性的东西，因为局部会有炎症的存在，而且刺激性的东西可能会加重溃疡的疼痛。
口腔溃疡的治疗以消除病因、增强体质、对症治疗为主，治疗方法应坚持全身治疗和局部治疗相结合，中西医治疗相结合，生理和心理治疗相结合。口腔溃疡常呈周期性发作，复发时间长短与口腔溃疡病史长短有密切关系。
临床所见口腔溃疡大多为复发性口腔溃疡，因为局部疼痛，影响饮食、语言等会给生活带来很大的困扰，所以有口腔溃疡后应该及时治疗，减轻症状。其治疗原则是消除致病诱因，增进机体健康，减轻局部症状，促进溃疡愈合，但是目前还没有特效药物，所以治疗时应针对每个病例的致病诱因和对药物的反应，有侧重地采用治疗方法和药物。
口腔溃疡的发生与免疫力低下，维生素缺乏感染有关，溃疡具有自限性，7-10天可以恢复，多吃蔬菜水果补充维生素，提高免疫力可以减少口腔溃疡的发生。反复发生的口腔溃疡，可以适当的应用激素类药物进行治疗，不要吃刺激的食物。